Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW13

RBM28, RNA-binding protein 28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM28Q9NW13 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBM28Q9NW13 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBM28Q9NW13 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBM28Q9NW13 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBM28Q9NW13 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBM28Q9NW13 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBM28Q9NW13 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBM28Q9NW13 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBM28Q9NW13 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBM28Q9NW13 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBM28Q9NW13 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBM28Q9NW13 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBM28Q9NW13 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBM28Q9NW13 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBM28Q9NW13 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RBM28Q9NW13 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBM28Q9NW13 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RBM28Q9NW13 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBM28Q9NW13 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBM28Q9NW13 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBM28Q9NW13 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBM28Q9NW13 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBM28Q9NW13 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBM28Q9NW13 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBM28Q9NW13 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBM28Q9NW13 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBM28Q9NW13 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBM28Q9NW13 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBM28Q9NW13 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBM28Q9NW13 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RBM28Q9NW13 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RBM28Q9NW13 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RBM28Q9NW13 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RBM28Q9NW13 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RBM28Q9NW13 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RBM28Q9NW13 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RBM28Q9NW13 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RBM28Q9NW13 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RBM28Q9NW13 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RBM28Q9NW13 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RBM28Q9NW13 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RBM28Q9NW13 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RBM28Q9NW13 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RBM28Q9NW13 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RBM28Q9NW13 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RBM28Q9NW13 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RBM28Q9NW13 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RBM28Q9NW13 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RBM28Q9NW13 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RBM28Q9NW13 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RBM28Q9NW13 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RBM28Q9NW13 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RBM28Q9NW13 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBM28Q9NW13 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBM28Q9NW13 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBM28Q9NW13 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBM28Q9NW13 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RBM28Q9NW13 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBM28Q9NW13 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBM28Q9NW13 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBM28Q9NW13 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBM28Q9NW13 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBM28Q9NW13 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBM28Q9NW13 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBM28Q9NW13 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBM28Q9NW13 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBM28Q9NW13 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBM28Q9NW13 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBM28Q9NW13 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBM28Q9NW13 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBM28Q9NW13 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBM28Q9NW13 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBM28Q9NW13 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBM28Q9NW13 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBM28Q9NW13 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBM28Q9NW13 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBM28Q9NW13 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBM28Q9NW13 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBM28Q9NW13 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBM28Q9NW13 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBM28Q9NW13 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBM28Q9NW13 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBM28Q9NW13 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBM28Q9NW13 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBM28Q9NW13 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBM28Q9NW13 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RBM28Q9NW13 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBM28Q9NW13 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBM28Q9NW13 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBM28Q9NW13 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBM28Q9NW13 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBM28Q9NW13 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBM28Q9NW13 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBM28Q9NW13 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBM28Q9NW13 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBM28Q9NW13 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBM28Q9NW13 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBM28Q9NW13 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RBM28Q9NW13 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBM28Q9NW13 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms