Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms