Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR81

ARHGEF3, Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3Q9NR81 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms