Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR00

C8orf4, Protein C8orf4, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf4Q9NR00 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms