Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQY0

BIN3, Bridging integrator 3, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIN3Q9NQY0 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms