Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ0

TNRC6C, Trinucleotide repeat-containing gene 6C protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC6CQ9HCJ0 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNRC6CQ9HCJ0 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNRC6CQ9HCJ0 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNRC6CQ9HCJ0 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNRC6CQ9HCJ0 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TNRC6CQ9HCJ0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNRC6CQ9HCJ0 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNRC6CQ9HCJ0 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNRC6CQ9HCJ0 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNRC6CQ9HCJ0 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TNRC6CQ9HCJ0 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNRC6CQ9HCJ0 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNRC6CQ9HCJ0 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNRC6CQ9HCJ0 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNRC6CQ9HCJ0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNRC6CQ9HCJ0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNRC6CQ9HCJ0 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNRC6CQ9HCJ0 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNRC6CQ9HCJ0 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNRC6CQ9HCJ0 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNRC6CQ9HCJ0 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNRC6CQ9HCJ0 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNRC6CQ9HCJ0 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNRC6CQ9HCJ0 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNRC6CQ9HCJ0 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNRC6CQ9HCJ0 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNRC6CQ9HCJ0 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNRC6CQ9HCJ0 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNRC6CQ9HCJ0 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNRC6CQ9HCJ0 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNRC6CQ9HCJ0 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNRC6CQ9HCJ0 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNRC6CQ9HCJ0 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNRC6CQ9HCJ0 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNRC6CQ9HCJ0 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNRC6CQ9HCJ0 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TNRC6CQ9HCJ0 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNRC6CQ9HCJ0 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNRC6CQ9HCJ0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNRC6CQ9HCJ0 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNRC6CQ9HCJ0 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNRC6CQ9HCJ0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNRC6CQ9HCJ0 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNRC6CQ9HCJ0 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNRC6CQ9HCJ0 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNRC6CQ9HCJ0 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNRC6CQ9HCJ0 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNRC6CQ9HCJ0 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNRC6CQ9HCJ0 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNRC6CQ9HCJ0 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNRC6CQ9HCJ0 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNRC6CQ9HCJ0 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNRC6CQ9HCJ0 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNRC6CQ9HCJ0 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TNRC6CQ9HCJ0 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNRC6CQ9HCJ0 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TNRC6CQ9HCJ0 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNRC6CQ9HCJ0 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNRC6CQ9HCJ0 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNRC6CQ9HCJ0 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNRC6CQ9HCJ0 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNRC6CQ9HCJ0 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNRC6CQ9HCJ0 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNRC6CQ9HCJ0 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNRC6CQ9HCJ0 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNRC6CQ9HCJ0 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNRC6CQ9HCJ0 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNRC6CQ9HCJ0 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNRC6CQ9HCJ0 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNRC6CQ9HCJ0 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TNRC6CQ9HCJ0 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNRC6CQ9HCJ0 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNRC6CQ9HCJ0 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNRC6CQ9HCJ0 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNRC6CQ9HCJ0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNRC6CQ9HCJ0 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNRC6CQ9HCJ0 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNRC6CQ9HCJ0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNRC6CQ9HCJ0 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TNRC6CQ9HCJ0 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TNRC6CQ9HCJ0 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNRC6CQ9HCJ0 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TNRC6CQ9HCJ0 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNRC6CQ9HCJ0 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TNRC6CQ9HCJ0 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNRC6CQ9HCJ0 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TNRC6CQ9HCJ0 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNRC6CQ9HCJ0 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNRC6CQ9HCJ0 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNRC6CQ9HCJ0 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNRC6CQ9HCJ0 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNRC6CQ9HCJ0 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNRC6CQ9HCJ0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNRC6CQ9HCJ0 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNRC6CQ9HCJ0 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TNRC6CQ9HCJ0 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNRC6CQ9HCJ0 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNRC6CQ9HCJ0 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNRC6CQ9HCJ0 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNRC6CQ9HCJ0 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms