Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBG7

LY9, T-lymphocyte surface antigen Ly-9, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY9Q9HBG7 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LY9Q9HBG7 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LY9Q9HBG7 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LY9Q9HBG7 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LY9Q9HBG7 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LY9Q9HBG7 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LY9Q9HBG7 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LY9Q9HBG7 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LY9Q9HBG7 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LY9Q9HBG7 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LY9Q9HBG7 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LY9Q9HBG7 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LY9Q9HBG7 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LY9Q9HBG7 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LY9Q9HBG7 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LY9Q9HBG7 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LY9Q9HBG7 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LY9Q9HBG7 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LY9Q9HBG7 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LY9Q9HBG7 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LY9Q9HBG7 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LY9Q9HBG7 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LY9Q9HBG7 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LY9Q9HBG7 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LY9Q9HBG7 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LY9Q9HBG7 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LY9Q9HBG7 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LY9Q9HBG7 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LY9Q9HBG7 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LY9Q9HBG7 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LY9Q9HBG7 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LY9Q9HBG7 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LY9Q9HBG7 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LY9Q9HBG7 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LY9Q9HBG7 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LY9Q9HBG7 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LY9Q9HBG7 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LY9Q9HBG7 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LY9Q9HBG7 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LY9Q9HBG7 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LY9Q9HBG7 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LY9Q9HBG7 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LY9Q9HBG7 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LY9Q9HBG7 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LY9Q9HBG7 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LY9Q9HBG7 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LY9Q9HBG7 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LY9Q9HBG7 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LY9Q9HBG7 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LY9Q9HBG7 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LY9Q9HBG7 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LY9Q9HBG7 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LY9Q9HBG7 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LY9Q9HBG7 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LY9Q9HBG7 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LY9Q9HBG7 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
LY9Q9HBG7 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
LY9Q9HBG7 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LY9Q9HBG7 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LY9Q9HBG7 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LY9Q9HBG7 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LY9Q9HBG7 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LY9Q9HBG7 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LY9Q9HBG7 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LY9Q9HBG7 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LY9Q9HBG7 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LY9Q9HBG7 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LY9Q9HBG7 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LY9Q9HBG7 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LY9Q9HBG7 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LY9Q9HBG7 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LY9Q9HBG7 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LY9Q9HBG7 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LY9Q9HBG7 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LY9Q9HBG7 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LY9Q9HBG7 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LY9Q9HBG7 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LY9Q9HBG7 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LY9Q9HBG7 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LY9Q9HBG7 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LY9Q9HBG7 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LY9Q9HBG7 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LY9Q9HBG7 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LY9Q9HBG7 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LY9Q9HBG7 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LY9Q9HBG7 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LY9Q9HBG7 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LY9Q9HBG7 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LY9Q9HBG7 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LY9Q9HBG7 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LY9Q9HBG7 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LY9Q9HBG7 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LY9Q9HBG7 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LY9Q9HBG7 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LY9Q9HBG7 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LY9Q9HBG7 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LY9Q9HBG7 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LY9Q9HBG7 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LY9Q9HBG7 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LY9Q9HBG7 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms