Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7N4

SCAF1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF1Q9H7N4 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SCAF1Q9H7N4 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SCAF1Q9H7N4 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SCAF1Q9H7N4 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SCAF1Q9H7N4 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SCAF1Q9H7N4 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SCAF1Q9H7N4 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SCAF1Q9H7N4 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SCAF1Q9H7N4 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SCAF1Q9H7N4 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SCAF1Q9H7N4 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SCAF1Q9H7N4 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SCAF1Q9H7N4 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SCAF1Q9H7N4 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SCAF1Q9H7N4 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SCAF1Q9H7N4 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
SCAF1Q9H7N4 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SCAF1Q9H7N4 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SCAF1Q9H7N4 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SCAF1Q9H7N4 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SCAF1Q9H7N4 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SCAF1Q9H7N4 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SCAF1Q9H7N4 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SCAF1Q9H7N4 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SCAF1Q9H7N4 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SCAF1Q9H7N4 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SCAF1Q9H7N4 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SCAF1Q9H7N4 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SCAF1Q9H7N4 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SCAF1Q9H7N4 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SCAF1Q9H7N4 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SCAF1Q9H7N4 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
SCAF1Q9H7N4 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SCAF1Q9H7N4 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SCAF1Q9H7N4 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SCAF1Q9H7N4 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SCAF1Q9H7N4 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SCAF1Q9H7N4 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SCAF1Q9H7N4 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SCAF1Q9H7N4 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SCAF1Q9H7N4 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
SCAF1Q9H7N4 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SCAF1Q9H7N4 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SCAF1Q9H7N4 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SCAF1Q9H7N4 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SCAF1Q9H7N4 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SCAF1Q9H7N4 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SCAF1Q9H7N4 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SCAF1Q9H7N4 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SCAF1Q9H7N4 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SCAF1Q9H7N4 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
SCAF1Q9H7N4 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SCAF1Q9H7N4 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SCAF1Q9H7N4 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SCAF1Q9H7N4 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SCAF1Q9H7N4 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SCAF1Q9H7N4 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SCAF1Q9H7N4 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SCAF1Q9H7N4 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SCAF1Q9H7N4 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SCAF1Q9H7N4 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SCAF1Q9H7N4 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SCAF1Q9H7N4 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SCAF1Q9H7N4 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SCAF1Q9H7N4 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SCAF1Q9H7N4 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SCAF1Q9H7N4 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SCAF1Q9H7N4 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SCAF1Q9H7N4 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
SCAF1Q9H7N4 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SCAF1Q9H7N4 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SCAF1Q9H7N4 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SCAF1Q9H7N4 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SCAF1Q9H7N4 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SCAF1Q9H7N4 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SCAF1Q9H7N4 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
SCAF1Q9H7N4 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SCAF1Q9H7N4 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SCAF1Q9H7N4 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SCAF1Q9H7N4 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SCAF1Q9H7N4 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SCAF1Q9H7N4 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SCAF1Q9H7N4 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SCAF1Q9H7N4 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SCAF1Q9H7N4 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SCAF1Q9H7N4 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SCAF1Q9H7N4 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SCAF1Q9H7N4 AC019205.2-201ENST00000442007 1083 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SCAF1Q9H7N4 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SCAF1Q9H7N4 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SCAF1Q9H7N4 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SCAF1Q9H7N4 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SCAF1Q9H7N4 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SCAF1Q9H7N4 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SCAF1Q9H7N4 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
SCAF1Q9H7N4 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SCAF1Q9H7N4 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SCAF1Q9H7N4 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SCAF1Q9H7N4 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SCAF1Q9H7N4 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms