Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2U6

LINC00597, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00597, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00597Q9H2U6 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
LINC00597Q9H2U6 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
LINC00597Q9H2U6 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
LINC00597Q9H2U6 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LINC00597Q9H2U6 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LINC00597Q9H2U6 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LINC00597Q9H2U6 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LINC00597Q9H2U6 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LINC00597Q9H2U6 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LINC00597Q9H2U6 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LINC00597Q9H2U6 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LINC00597Q9H2U6 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LINC00597Q9H2U6 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
LINC00597Q9H2U6 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LINC00597Q9H2U6 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LINC00597Q9H2U6 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LINC00597Q9H2U6 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LINC00597Q9H2U6 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LINC00597Q9H2U6 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LINC00597Q9H2U6 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LINC00597Q9H2U6 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LINC00597Q9H2U6 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LINC00597Q9H2U6 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
LINC00597Q9H2U6 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LINC00597Q9H2U6 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LINC00597Q9H2U6 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LINC00597Q9H2U6 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LINC00597Q9H2U6 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LINC00597Q9H2U6 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LINC00597Q9H2U6 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LINC00597Q9H2U6 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LINC00597Q9H2U6 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LINC00597Q9H2U6 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LINC00597Q9H2U6 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LINC00597Q9H2U6 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LINC00597Q9H2U6 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LINC00597Q9H2U6 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LINC00597Q9H2U6 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LINC00597Q9H2U6 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LINC00597Q9H2U6 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LINC00597Q9H2U6 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LINC00597Q9H2U6 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LINC00597Q9H2U6 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LINC00597Q9H2U6 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LINC00597Q9H2U6 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LINC00597Q9H2U6 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LINC00597Q9H2U6 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LINC00597Q9H2U6 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
LINC00597Q9H2U6 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LINC00597Q9H2U6 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LINC00597Q9H2U6 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LINC00597Q9H2U6 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LINC00597Q9H2U6 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LINC00597Q9H2U6 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LINC00597Q9H2U6 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LINC00597Q9H2U6 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LINC00597Q9H2U6 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LINC00597Q9H2U6 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LINC00597Q9H2U6 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LINC00597Q9H2U6 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LINC00597Q9H2U6 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LINC00597Q9H2U6 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LINC00597Q9H2U6 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LINC00597Q9H2U6 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LINC00597Q9H2U6 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LINC00597Q9H2U6 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LINC00597Q9H2U6 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LINC00597Q9H2U6 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LINC00597Q9H2U6 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LINC00597Q9H2U6 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LINC00597Q9H2U6 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LINC00597Q9H2U6 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LINC00597Q9H2U6 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LINC00597Q9H2U6 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LINC00597Q9H2U6 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LINC00597Q9H2U6 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LINC00597Q9H2U6 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LINC00597Q9H2U6 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
LINC00597Q9H2U6 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LINC00597Q9H2U6 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LINC00597Q9H2U6 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LINC00597Q9H2U6 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LINC00597Q9H2U6 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
LINC00597Q9H2U6 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LINC00597Q9H2U6 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LINC00597Q9H2U6 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LINC00597Q9H2U6 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LINC00597Q9H2U6 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LINC00597Q9H2U6 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LINC00597Q9H2U6 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LINC00597Q9H2U6 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LINC00597Q9H2U6 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LINC00597Q9H2U6 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LINC00597Q9H2U6 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LINC00597Q9H2U6 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LINC00597Q9H2U6 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LINC00597Q9H2U6 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LINC00597Q9H2U6 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LINC00597Q9H2U6 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
LINC00597Q9H2U6 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms