Protein–RNA interactions for Protein: Q9H299

SH3BGRL3, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRL3Q9H299 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BGRL3Q9H299 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BGRL3Q9H299 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BGRL3Q9H299 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BGRL3Q9H299 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BGRL3Q9H299 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BGRL3Q9H299 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BGRL3Q9H299 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BGRL3Q9H299 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BGRL3Q9H299 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BGRL3Q9H299 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BGRL3Q9H299 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BGRL3Q9H299 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BGRL3Q9H299 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BGRL3Q9H299 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BGRL3Q9H299 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BGRL3Q9H299 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BGRL3Q9H299 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BGRL3Q9H299 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BGRL3Q9H299 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BGRL3Q9H299 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BGRL3Q9H299 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BGRL3Q9H299 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BGRL3Q9H299 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BGRL3Q9H299 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BGRL3Q9H299 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BGRL3Q9H299 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BGRL3Q9H299 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BGRL3Q9H299 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BGRL3Q9H299 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BGRL3Q9H299 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BGRL3Q9H299 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BGRL3Q9H299 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BGRL3Q9H299 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BGRL3Q9H299 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BGRL3Q9H299 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BGRL3Q9H299 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BGRL3Q9H299 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BGRL3Q9H299 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BGRL3Q9H299 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BGRL3Q9H299 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BGRL3Q9H299 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BGRL3Q9H299 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BGRL3Q9H299 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BGRL3Q9H299 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BGRL3Q9H299 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BGRL3Q9H299 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BGRL3Q9H299 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BGRL3Q9H299 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BGRL3Q9H299 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BGRL3Q9H299 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BGRL3Q9H299 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BGRL3Q9H299 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BGRL3Q9H299 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BGRL3Q9H299 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BGRL3Q9H299 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BGRL3Q9H299 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BGRL3Q9H299 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BGRL3Q9H299 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BGRL3Q9H299 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BGRL3Q9H299 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BGRL3Q9H299 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BGRL3Q9H299 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BGRL3Q9H299 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BGRL3Q9H299 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BGRL3Q9H299 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BGRL3Q9H299 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BGRL3Q9H299 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BGRL3Q9H299 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BGRL3Q9H299 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BGRL3Q9H299 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BGRL3Q9H299 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BGRL3Q9H299 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BGRL3Q9H299 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BGRL3Q9H299 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BGRL3Q9H299 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BGRL3Q9H299 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BGRL3Q9H299 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BGRL3Q9H299 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BGRL3Q9H299 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BGRL3Q9H299 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BGRL3Q9H299 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BGRL3Q9H299 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BGRL3Q9H299 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BGRL3Q9H299 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BGRL3Q9H299 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BGRL3Q9H299 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BGRL3Q9H299 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BGRL3Q9H299 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BGRL3Q9H299 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BGRL3Q9H299 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BGRL3Q9H299 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BGRL3Q9H299 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BGRL3Q9H299 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BGRL3Q9H299 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BGRL3Q9H299 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BGRL3Q9H299 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BGRL3Q9H299 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BGRL3Q9H299 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BGRL3Q9H299 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms