Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU5

NYX, Nyctalopin, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NYXQ9GZU5 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NYXQ9GZU5 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NYXQ9GZU5 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NYXQ9GZU5 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NYXQ9GZU5 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NYXQ9GZU5 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NYXQ9GZU5 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NYXQ9GZU5 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NYXQ9GZU5 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NYXQ9GZU5 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NYXQ9GZU5 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NYXQ9GZU5 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NYXQ9GZU5 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NYXQ9GZU5 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NYXQ9GZU5 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NYXQ9GZU5 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NYXQ9GZU5 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NYXQ9GZU5 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NYXQ9GZU5 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NYXQ9GZU5 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NYXQ9GZU5 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NYXQ9GZU5 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NYXQ9GZU5 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NYXQ9GZU5 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NYXQ9GZU5 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NYXQ9GZU5 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NYXQ9GZU5 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NYXQ9GZU5 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NYXQ9GZU5 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NYXQ9GZU5 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NYXQ9GZU5 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NYXQ9GZU5 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NYXQ9GZU5 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NYXQ9GZU5 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NYXQ9GZU5 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NYXQ9GZU5 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NYXQ9GZU5 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NYXQ9GZU5 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NYXQ9GZU5 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NYXQ9GZU5 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NYXQ9GZU5 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NYXQ9GZU5 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NYXQ9GZU5 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NYXQ9GZU5 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NYXQ9GZU5 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NYXQ9GZU5 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NYXQ9GZU5 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NYXQ9GZU5 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NYXQ9GZU5 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NYXQ9GZU5 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NYXQ9GZU5 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NYXQ9GZU5 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NYXQ9GZU5 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NYXQ9GZU5 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NYXQ9GZU5 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NYXQ9GZU5 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NYXQ9GZU5 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NYXQ9GZU5 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NYXQ9GZU5 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NYXQ9GZU5 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NYXQ9GZU5 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NYXQ9GZU5 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NYXQ9GZU5 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NYXQ9GZU5 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NYXQ9GZU5 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NYXQ9GZU5 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NYXQ9GZU5 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NYXQ9GZU5 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NYXQ9GZU5 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NYXQ9GZU5 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NYXQ9GZU5 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NYXQ9GZU5 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NYXQ9GZU5 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NYXQ9GZU5 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NYXQ9GZU5 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NYXQ9GZU5 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NYXQ9GZU5 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NYXQ9GZU5 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NYXQ9GZU5 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NYXQ9GZU5 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NYXQ9GZU5 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NYXQ9GZU5 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NYXQ9GZU5 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NYXQ9GZU5 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NYXQ9GZU5 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NYXQ9GZU5 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NYXQ9GZU5 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NYXQ9GZU5 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NYXQ9GZU5 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NYXQ9GZU5 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NYXQ9GZU5 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NYXQ9GZU5 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NYXQ9GZU5 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NYXQ9GZU5 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NYXQ9GZU5 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NYXQ9GZU5 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NYXQ9GZU5 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NYXQ9GZU5 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NYXQ9GZU5 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NYXQ9GZU5 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms