Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZS1

POLR1E, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1EQ9GZS1 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLR1EQ9GZS1 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLR1EQ9GZS1 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLR1EQ9GZS1 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLR1EQ9GZS1 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLR1EQ9GZS1 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLR1EQ9GZS1 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLR1EQ9GZS1 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLR1EQ9GZS1 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLR1EQ9GZS1 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLR1EQ9GZS1 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR1EQ9GZS1 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR1EQ9GZS1 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR1EQ9GZS1 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR1EQ9GZS1 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR1EQ9GZS1 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR1EQ9GZS1 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR1EQ9GZS1 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR1EQ9GZS1 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR1EQ9GZS1 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR1EQ9GZS1 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR1EQ9GZS1 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR1EQ9GZS1 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR1EQ9GZS1 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR1EQ9GZS1 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR1EQ9GZS1 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR1EQ9GZS1 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR1EQ9GZS1 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR1EQ9GZS1 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR1EQ9GZS1 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR1EQ9GZS1 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR1EQ9GZS1 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR1EQ9GZS1 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR1EQ9GZS1 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR1EQ9GZS1 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR1EQ9GZS1 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR1EQ9GZS1 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR1EQ9GZS1 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR1EQ9GZS1 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR1EQ9GZS1 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR1EQ9GZS1 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR1EQ9GZS1 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR1EQ9GZS1 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR1EQ9GZS1 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR1EQ9GZS1 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR1EQ9GZS1 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR1EQ9GZS1 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR1EQ9GZS1 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR1EQ9GZS1 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR1EQ9GZS1 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR1EQ9GZS1 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR1EQ9GZS1 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR1EQ9GZS1 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR1EQ9GZS1 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR1EQ9GZS1 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR1EQ9GZS1 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR1EQ9GZS1 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR1EQ9GZS1 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR1EQ9GZS1 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR1EQ9GZS1 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR1EQ9GZS1 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR1EQ9GZS1 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR1EQ9GZS1 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR1EQ9GZS1 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR1EQ9GZS1 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR1EQ9GZS1 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR1EQ9GZS1 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR1EQ9GZS1 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR1EQ9GZS1 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR1EQ9GZS1 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR1EQ9GZS1 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR1EQ9GZS1 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR1EQ9GZS1 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR1EQ9GZS1 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR1EQ9GZS1 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR1EQ9GZS1 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR1EQ9GZS1 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR1EQ9GZS1 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR1EQ9GZS1 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR1EQ9GZS1 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR1EQ9GZS1 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR1EQ9GZS1 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR1EQ9GZS1 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR1EQ9GZS1 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR1EQ9GZS1 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR1EQ9GZS1 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR1EQ9GZS1 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR1EQ9GZS1 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR1EQ9GZS1 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR1EQ9GZS1 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR1EQ9GZS1 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR1EQ9GZS1 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR1EQ9GZS1 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR1EQ9GZS1 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR1EQ9GZS1 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR1EQ9GZS1 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR1EQ9GZS1 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR1EQ9GZS1 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR1EQ9GZS1 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR1EQ9GZS1 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms