Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms