Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D2

CEP295, Centrosomal protein of 295 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 2,601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP295Q9C0D2 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CEP295Q9C0D2 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CEP295Q9C0D2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CEP295Q9C0D2 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CEP295Q9C0D2 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CEP295Q9C0D2 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CEP295Q9C0D2 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CEP295Q9C0D2 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CEP295Q9C0D2 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CEP295Q9C0D2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CEP295Q9C0D2 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CEP295Q9C0D2 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CEP295Q9C0D2 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CEP295Q9C0D2 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CEP295Q9C0D2 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CEP295Q9C0D2 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CEP295Q9C0D2 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CEP295Q9C0D2 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CEP295Q9C0D2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CEP295Q9C0D2 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CEP295Q9C0D2 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CEP295Q9C0D2 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CEP295Q9C0D2 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CEP295Q9C0D2 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CEP295Q9C0D2 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CEP295Q9C0D2 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CEP295Q9C0D2 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CEP295Q9C0D2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CEP295Q9C0D2 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CEP295Q9C0D2 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CEP295Q9C0D2 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CEP295Q9C0D2 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CEP295Q9C0D2 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CEP295Q9C0D2 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CEP295Q9C0D2 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CEP295Q9C0D2 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CEP295Q9C0D2 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CEP295Q9C0D2 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CEP295Q9C0D2 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CEP295Q9C0D2 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CEP295Q9C0D2 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CEP295Q9C0D2 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CEP295Q9C0D2 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CEP295Q9C0D2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CEP295Q9C0D2 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CEP295Q9C0D2 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CEP295Q9C0D2 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CEP295Q9C0D2 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CEP295Q9C0D2 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CEP295Q9C0D2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CEP295Q9C0D2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CEP295Q9C0D2 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CEP295Q9C0D2 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CEP295Q9C0D2 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CEP295Q9C0D2 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CEP295Q9C0D2 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CEP295Q9C0D2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CEP295Q9C0D2 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CEP295Q9C0D2 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CEP295Q9C0D2 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CEP295Q9C0D2 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CEP295Q9C0D2 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CEP295Q9C0D2 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CEP295Q9C0D2 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CEP295Q9C0D2 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CEP295Q9C0D2 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CEP295Q9C0D2 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CEP295Q9C0D2 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CEP295Q9C0D2 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CEP295Q9C0D2 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CEP295Q9C0D2 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CEP295Q9C0D2 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CEP295Q9C0D2 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CEP295Q9C0D2 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CEP295Q9C0D2 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CEP295Q9C0D2 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CEP295Q9C0D2 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CEP295Q9C0D2 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CEP295Q9C0D2 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CEP295Q9C0D2 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CEP295Q9C0D2 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CEP295Q9C0D2 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CEP295Q9C0D2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CEP295Q9C0D2 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CEP295Q9C0D2 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CEP295Q9C0D2 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CEP295Q9C0D2 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CEP295Q9C0D2 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CEP295Q9C0D2 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CEP295Q9C0D2 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CEP295Q9C0D2 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CEP295Q9C0D2 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CEP295Q9C0D2 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CEP295Q9C0D2 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CEP295Q9C0D2 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CEP295Q9C0D2 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CEP295Q9C0D2 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CEP295Q9C0D2 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CEP295Q9C0D2 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CEP295Q9C0D2 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms