Protein–RNA interactions for Protein: Q9C099

LRRCC1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRCC1Q9C099 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRCC1Q9C099 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRCC1Q9C099 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRCC1Q9C099 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRCC1Q9C099 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRCC1Q9C099 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRCC1Q9C099 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRCC1Q9C099 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRCC1Q9C099 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRCC1Q9C099 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRCC1Q9C099 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRCC1Q9C099 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRCC1Q9C099 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRCC1Q9C099 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRCC1Q9C099 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRCC1Q9C099 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRCC1Q9C099 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRCC1Q9C099 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRCC1Q9C099 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRCC1Q9C099 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRCC1Q9C099 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRCC1Q9C099 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRCC1Q9C099 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRCC1Q9C099 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRCC1Q9C099 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRCC1Q9C099 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRCC1Q9C099 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRCC1Q9C099 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRCC1Q9C099 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRCC1Q9C099 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRCC1Q9C099 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRCC1Q9C099 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRCC1Q9C099 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRCC1Q9C099 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRCC1Q9C099 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRCC1Q9C099 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRCC1Q9C099 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRCC1Q9C099 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRCC1Q9C099 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRCC1Q9C099 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRCC1Q9C099 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRCC1Q9C099 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRCC1Q9C099 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRCC1Q9C099 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRCC1Q9C099 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRCC1Q9C099 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRCC1Q9C099 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRCC1Q9C099 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRCC1Q9C099 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRCC1Q9C099 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRCC1Q9C099 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRCC1Q9C099 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRCC1Q9C099 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRCC1Q9C099 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRCC1Q9C099 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRCC1Q9C099 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRCC1Q9C099 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRCC1Q9C099 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRCC1Q9C099 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRCC1Q9C099 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRCC1Q9C099 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRCC1Q9C099 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRCC1Q9C099 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRCC1Q9C099 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRCC1Q9C099 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRCC1Q9C099 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRCC1Q9C099 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRCC1Q9C099 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRCC1Q9C099 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRCC1Q9C099 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRCC1Q9C099 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRCC1Q9C099 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LRRCC1Q9C099 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LRRCC1Q9C099 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRCC1Q9C099 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRCC1Q9C099 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRCC1Q9C099 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRCC1Q9C099 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRCC1Q9C099 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRCC1Q9C099 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRCC1Q9C099 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRCC1Q9C099 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRCC1Q9C099 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRCC1Q9C099 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRCC1Q9C099 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRCC1Q9C099 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRCC1Q9C099 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRCC1Q9C099 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRCC1Q9C099 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRCC1Q9C099 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRCC1Q9C099 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRCC1Q9C099 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRCC1Q9C099 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRCC1Q9C099 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRCC1Q9C099 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRCC1Q9C099 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRCC1Q9C099 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRCC1Q9C099 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRCC1Q9C099 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRCC1Q9C099 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms