Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ2

KRTAP9-4, Keratin-associated protein 9-4, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-4Q9BYQ2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 SH3YL1-205ENST00000403712 1695 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 CA6-203ENST00000377443 1319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 FO393409.1-201ENST00000399325 1372 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 MAPKAPK5P1-201ENST00000431810 1376 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 DDX47-201ENST00000352940 1698 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL034548.1-201ENST00000608495 1672 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 TCTN3-202ENST00000371209 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 NUDT7-201ENST00000268533 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 FAM24A-201ENST00000368894 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 GSTA8P-201ENST00000404253 637 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL513325.1-201ENST00000417716 1034 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC073987.1-201ENST00000422683 638 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 RPL12P19-201ENST00000429825 486 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 CA1-201ENST00000431316 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 Z99758.1-201ENST00000432081 368 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL121759.1-201ENST00000434043 795 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 CD46P1-201ENST00000441364 763 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 RAB11AP1-201ENST00000442978 646 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 VN1R10P-201ENST00000447106 875 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 SEC11A-202ENST00000455959 1223 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 CFTRP1-201ENST00000456646 183 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 BET1P1-201ENST00000482276 359 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 SKA1-204ENST00000488454 669 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC106868.1-201ENST00000505272 992 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC106872.4-201ENST00000510050 523 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC021193.1-201ENST00000511607 420 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 MTCO2P32-201ENST00000514865 403 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC084768.1-201ENST00000518926 923 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC022973.2-201ENST00000520146 549 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 ENY2-210ENST00000521662 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 GLYAT-203ENST00000529732 1070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF175-203ENST00000545217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC025580.1-201ENST00000559553 729 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 SEC11A-209ENST00000560266 1089 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC091691.1-201ENST00000583587 1018 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC242426.3-203ENST00000606757 712 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 ALG13-230ENST00000623189 458 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC233300.1-201ENST00000624323 817 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 AP003072.4-201ENST00000624580 310 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC005785.2-201ENST00000624655 631 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 OR5H15-202ENST00000641450 1229 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC130464.1-201ENST00000416201 1500 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 MR1-201ENST00000282990 2043 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 RBMY2FP-201ENST00000303922 2042 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 TFB1M-201ENST00000367166 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 GABPB1-210ENST00000560825 1412 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 KNSTRN-216ENST00000608100 1495 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 AF064860.2-201ENST00000457325 1542 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 FMO9P-202ENST00000488458 1535 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 CKS1B-201ENST00000308987 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 Y_RNA.194-201ENST00000363985 102 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 BMS1P3-201ENST00000372011 932 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 ATP5F1P2-201ENST00000398143 760 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 RN7SKP65-201ENST00000410278 313 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms