Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PCGF6Q9BYE7 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PCGF6Q9BYE7 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PCGF6Q9BYE7 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PCGF6Q9BYE7 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PCGF6Q9BYE7 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PCGF6Q9BYE7 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PCGF6Q9BYE7 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PCGF6Q9BYE7 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PCGF6Q9BYE7 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PCGF6Q9BYE7 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PCGF6Q9BYE7 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PCGF6Q9BYE7 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
PCGF6Q9BYE7 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
PCGF6Q9BYE7 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PCGF6Q9BYE7 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PCGF6Q9BYE7 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PCGF6Q9BYE7 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PCGF6Q9BYE7 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PCGF6Q9BYE7 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PCGF6Q9BYE7 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PCGF6Q9BYE7 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PCGF6Q9BYE7 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PCGF6Q9BYE7 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PCGF6Q9BYE7 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PCGF6Q9BYE7 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PCGF6Q9BYE7 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PCGF6Q9BYE7 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PCGF6Q9BYE7 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PCGF6Q9BYE7 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PCGF6Q9BYE7 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PCGF6Q9BYE7 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PCGF6Q9BYE7 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PCGF6Q9BYE7 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PCGF6Q9BYE7 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PCGF6Q9BYE7 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PCGF6Q9BYE7 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PCGF6Q9BYE7 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
PCGF6Q9BYE7 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PCGF6Q9BYE7 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PCGF6Q9BYE7 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PCGF6Q9BYE7 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PCGF6Q9BYE7 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PCGF6Q9BYE7 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PCGF6Q9BYE7 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PCGF6Q9BYE7 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PCGF6Q9BYE7 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PCGF6Q9BYE7 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PCGF6Q9BYE7 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PCGF6Q9BYE7 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
PCGF6Q9BYE7 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
PCGF6Q9BYE7 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
PCGF6Q9BYE7 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
PCGF6Q9BYE7 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PCGF6Q9BYE7 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PCGF6Q9BYE7 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PCGF6Q9BYE7 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PCGF6Q9BYE7 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PCGF6Q9BYE7 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PCGF6Q9BYE7 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PCGF6Q9BYE7 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PCGF6Q9BYE7 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PCGF6Q9BYE7 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PCGF6Q9BYE7 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PCGF6Q9BYE7 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PCGF6Q9BYE7 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PCGF6Q9BYE7 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PCGF6Q9BYE7 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PCGF6Q9BYE7 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
PCGF6Q9BYE7 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PCGF6Q9BYE7 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PCGF6Q9BYE7 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PCGF6Q9BYE7 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PCGF6Q9BYE7 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PCGF6Q9BYE7 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PCGF6Q9BYE7 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PCGF6Q9BYE7 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PCGF6Q9BYE7 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PCGF6Q9BYE7 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PCGF6Q9BYE7 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PCGF6Q9BYE7 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PCGF6Q9BYE7 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PCGF6Q9BYE7 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PCGF6Q9BYE7 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PCGF6Q9BYE7 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PCGF6Q9BYE7 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PCGF6Q9BYE7 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PCGF6Q9BYE7 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PCGF6Q9BYE7 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PCGF6Q9BYE7 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PCGF6Q9BYE7 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PCGF6Q9BYE7 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PCGF6Q9BYE7 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PCGF6Q9BYE7 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PCGF6Q9BYE7 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PCGF6Q9BYE7 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PCGF6Q9BYE7 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PCGF6Q9BYE7 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PCGF6Q9BYE7 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PCGF6Q9BYE7 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms