Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYB0

SHANK3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK3Q9BYB0 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SHANK3Q9BYB0 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SHANK3Q9BYB0 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SHANK3Q9BYB0 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SHANK3Q9BYB0 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SHANK3Q9BYB0 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SHANK3Q9BYB0 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SHANK3Q9BYB0 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SHANK3Q9BYB0 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SHANK3Q9BYB0 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHANK3Q9BYB0 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHANK3Q9BYB0 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHANK3Q9BYB0 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHANK3Q9BYB0 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHANK3Q9BYB0 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHANK3Q9BYB0 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHANK3Q9BYB0 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHANK3Q9BYB0 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SHANK3Q9BYB0 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHANK3Q9BYB0 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHANK3Q9BYB0 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHANK3Q9BYB0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHANK3Q9BYB0 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHANK3Q9BYB0 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHANK3Q9BYB0 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHANK3Q9BYB0 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHANK3Q9BYB0 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHANK3Q9BYB0 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHANK3Q9BYB0 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHANK3Q9BYB0 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHANK3Q9BYB0 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHANK3Q9BYB0 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHANK3Q9BYB0 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHANK3Q9BYB0 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHANK3Q9BYB0 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHANK3Q9BYB0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHANK3Q9BYB0 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHANK3Q9BYB0 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHANK3Q9BYB0 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHANK3Q9BYB0 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHANK3Q9BYB0 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SHANK3Q9BYB0 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SHANK3Q9BYB0 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SHANK3Q9BYB0 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SHANK3Q9BYB0 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SHANK3Q9BYB0 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SHANK3Q9BYB0 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SHANK3Q9BYB0 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SHANK3Q9BYB0 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SHANK3Q9BYB0 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SHANK3Q9BYB0 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SHANK3Q9BYB0 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SHANK3Q9BYB0 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SHANK3Q9BYB0 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SHANK3Q9BYB0 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SHANK3Q9BYB0 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SHANK3Q9BYB0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SHANK3Q9BYB0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SHANK3Q9BYB0 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SHANK3Q9BYB0 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SHANK3Q9BYB0 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SHANK3Q9BYB0 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SHANK3Q9BYB0 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SHANK3Q9BYB0 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SHANK3Q9BYB0 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SHANK3Q9BYB0 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SHANK3Q9BYB0 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SHANK3Q9BYB0 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SHANK3Q9BYB0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SHANK3Q9BYB0 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SHANK3Q9BYB0 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SHANK3Q9BYB0 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SHANK3Q9BYB0 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SHANK3Q9BYB0 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SHANK3Q9BYB0 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SHANK3Q9BYB0 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SHANK3Q9BYB0 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SHANK3Q9BYB0 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SHANK3Q9BYB0 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SHANK3Q9BYB0 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SHANK3Q9BYB0 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SHANK3Q9BYB0 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SHANK3Q9BYB0 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
SHANK3Q9BYB0 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SHANK3Q9BYB0 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SHANK3Q9BYB0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SHANK3Q9BYB0 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SHANK3Q9BYB0 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SHANK3Q9BYB0 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SHANK3Q9BYB0 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SHANK3Q9BYB0 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SHANK3Q9BYB0 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SHANK3Q9BYB0 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SHANK3Q9BYB0 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SHANK3Q9BYB0 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SHANK3Q9BYB0 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SHANK3Q9BYB0 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SHANK3Q9BYB0 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SHANK3Q9BYB0 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SHANK3Q9BYB0 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms