Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms