Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
SCAPERQ9BY12 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
SCAPERQ9BY12 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SCAPERQ9BY12 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SCAPERQ9BY12 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
SCAPERQ9BY12 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SCAPERQ9BY12 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SCAPERQ9BY12 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SCAPERQ9BY12 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SCAPERQ9BY12 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SCAPERQ9BY12 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SCAPERQ9BY12 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SCAPERQ9BY12 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
SCAPERQ9BY12 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
SCAPERQ9BY12 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SCAPERQ9BY12 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SCAPERQ9BY12 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SCAPERQ9BY12 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
SCAPERQ9BY12 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
SCAPERQ9BY12 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
SCAPERQ9BY12 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SCAPERQ9BY12 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SCAPERQ9BY12 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SCAPERQ9BY12 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SCAPERQ9BY12 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SCAPERQ9BY12 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SCAPERQ9BY12 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SCAPERQ9BY12 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SCAPERQ9BY12 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SCAPERQ9BY12 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SCAPERQ9BY12 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SCAPERQ9BY12 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SCAPERQ9BY12 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SCAPERQ9BY12 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SCAPERQ9BY12 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SCAPERQ9BY12 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
SCAPERQ9BY12 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SCAPERQ9BY12 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SCAPERQ9BY12 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SCAPERQ9BY12 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SCAPERQ9BY12 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SCAPERQ9BY12 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SCAPERQ9BY12 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SCAPERQ9BY12 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SCAPERQ9BY12 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SCAPERQ9BY12 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SCAPERQ9BY12 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SCAPERQ9BY12 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SCAPERQ9BY12 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SCAPERQ9BY12 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SCAPERQ9BY12 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SCAPERQ9BY12 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SCAPERQ9BY12 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
SCAPERQ9BY12 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SCAPERQ9BY12 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SCAPERQ9BY12 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SCAPERQ9BY12 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SCAPERQ9BY12 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SCAPERQ9BY12 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SCAPERQ9BY12 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SCAPERQ9BY12 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SCAPERQ9BY12 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SCAPERQ9BY12 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SCAPERQ9BY12 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SCAPERQ9BY12 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
SCAPERQ9BY12 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SCAPERQ9BY12 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SCAPERQ9BY12 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SCAPERQ9BY12 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
SCAPERQ9BY12 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
SCAPERQ9BY12 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
SCAPERQ9BY12 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
SCAPERQ9BY12 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SCAPERQ9BY12 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SCAPERQ9BY12 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SCAPERQ9BY12 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SCAPERQ9BY12 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SCAPERQ9BY12 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SCAPERQ9BY12 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SCAPERQ9BY12 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SCAPERQ9BY12 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SCAPERQ9BY12 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SCAPERQ9BY12 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SCAPERQ9BY12 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SCAPERQ9BY12 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SCAPERQ9BY12 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
SCAPERQ9BY12 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SCAPERQ9BY12 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SCAPERQ9BY12 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SCAPERQ9BY12 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
SCAPERQ9BY12 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SCAPERQ9BY12 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SCAPERQ9BY12 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SCAPERQ9BY12 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SCAPERQ9BY12 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SCAPERQ9BY12 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SCAPERQ9BY12 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SCAPERQ9BY12 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SCAPERQ9BY12 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SCAPERQ9BY12 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms