Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms