Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
RNF17Q9BXT8 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
RNF17Q9BXT8 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
RNF17Q9BXT8 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RNF17Q9BXT8 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RNF17Q9BXT8 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RNF17Q9BXT8 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RNF17Q9BXT8 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RNF17Q9BXT8 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RNF17Q9BXT8 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RNF17Q9BXT8 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RNF17Q9BXT8 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RNF17Q9BXT8 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RNF17Q9BXT8 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RNF17Q9BXT8 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RNF17Q9BXT8 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RNF17Q9BXT8 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RNF17Q9BXT8 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RNF17Q9BXT8 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RNF17Q9BXT8 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RNF17Q9BXT8 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RNF17Q9BXT8 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RNF17Q9BXT8 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RNF17Q9BXT8 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RNF17Q9BXT8 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RNF17Q9BXT8 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RNF17Q9BXT8 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RNF17Q9BXT8 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RNF17Q9BXT8 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
RNF17Q9BXT8 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RNF17Q9BXT8 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RNF17Q9BXT8 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RNF17Q9BXT8 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RNF17Q9BXT8 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RNF17Q9BXT8 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RNF17Q9BXT8 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RNF17Q9BXT8 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RNF17Q9BXT8 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RNF17Q9BXT8 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RNF17Q9BXT8 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RNF17Q9BXT8 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RNF17Q9BXT8 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RNF17Q9BXT8 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RNF17Q9BXT8 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RNF17Q9BXT8 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RNF17Q9BXT8 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RNF17Q9BXT8 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RNF17Q9BXT8 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RNF17Q9BXT8 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RNF17Q9BXT8 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RNF17Q9BXT8 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RNF17Q9BXT8 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RNF17Q9BXT8 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RNF17Q9BXT8 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RNF17Q9BXT8 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RNF17Q9BXT8 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RNF17Q9BXT8 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RNF17Q9BXT8 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RNF17Q9BXT8 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RNF17Q9BXT8 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RNF17Q9BXT8 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RNF17Q9BXT8 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RNF17Q9BXT8 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RNF17Q9BXT8 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RNF17Q9BXT8 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RNF17Q9BXT8 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RNF17Q9BXT8 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RNF17Q9BXT8 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RNF17Q9BXT8 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RNF17Q9BXT8 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
RNF17Q9BXT8 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
RNF17Q9BXT8 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RNF17Q9BXT8 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
RNF17Q9BXT8 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
RNF17Q9BXT8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RNF17Q9BXT8 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RNF17Q9BXT8 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RNF17Q9BXT8 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RNF17Q9BXT8 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RNF17Q9BXT8 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RNF17Q9BXT8 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
RNF17Q9BXT8 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RNF17Q9BXT8 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
RNF17Q9BXT8 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RNF17Q9BXT8 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RNF17Q9BXT8 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RNF17Q9BXT8 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RNF17Q9BXT8 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RNF17Q9BXT8 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RNF17Q9BXT8 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RNF17Q9BXT8 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RNF17Q9BXT8 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RNF17Q9BXT8 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RNF17Q9BXT8 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RNF17Q9BXT8 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RNF17Q9BXT8 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RNF17Q9BXT8 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RNF17Q9BXT8 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RNF17Q9BXT8 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RNF17Q9BXT8 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms