Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms