Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
MEIS3Q99687 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MEIS3Q99687 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MEIS3Q99687 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MEIS3Q99687 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MEIS3Q99687 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MEIS3Q99687 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MEIS3Q99687 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MEIS3Q99687 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MEIS3Q99687 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MEIS3Q99687 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MEIS3Q99687 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MEIS3Q99687 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MEIS3Q99687 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MEIS3Q99687 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
MEIS3Q99687 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MEIS3Q99687 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MEIS3Q99687 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
MEIS3Q99687 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MEIS3Q99687 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MEIS3Q99687 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MEIS3Q99687 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MEIS3Q99687 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MEIS3Q99687 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MEIS3Q99687 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MEIS3Q99687 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MEIS3Q99687 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
MEIS3Q99687 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MEIS3Q99687 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MEIS3Q99687 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MEIS3Q99687 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MEIS3Q99687 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MEIS3Q99687 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MEIS3Q99687 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MEIS3Q99687 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MEIS3Q99687 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MEIS3Q99687 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MEIS3Q99687 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MEIS3Q99687 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
MEIS3Q99687 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MEIS3Q99687 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MEIS3Q99687 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MEIS3Q99687 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MEIS3Q99687 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MEIS3Q99687 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MEIS3Q99687 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MEIS3Q99687 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MEIS3Q99687 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MEIS3Q99687 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MEIS3Q99687 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MEIS3Q99687 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MEIS3Q99687 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MEIS3Q99687 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MEIS3Q99687 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MEIS3Q99687 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MEIS3Q99687 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
MEIS3Q99687 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
MEIS3Q99687 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MEIS3Q99687 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MEIS3Q99687 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MEIS3Q99687 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MEIS3Q99687 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MEIS3Q99687 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MEIS3Q99687 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MEIS3Q99687 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MEIS3Q99687 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MEIS3Q99687 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
MEIS3Q99687 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MEIS3Q99687 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MEIS3Q99687 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MEIS3Q99687 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MEIS3Q99687 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MEIS3Q99687 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MEIS3Q99687 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MEIS3Q99687 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MEIS3Q99687 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MEIS3Q99687 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MEIS3Q99687 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MEIS3Q99687 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MEIS3Q99687 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MEIS3Q99687 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MEIS3Q99687 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MEIS3Q99687 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MEIS3Q99687 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MEIS3Q99687 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MEIS3Q99687 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MEIS3Q99687 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MEIS3Q99687 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MEIS3Q99687 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MEIS3Q99687 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MEIS3Q99687 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MEIS3Q99687 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MEIS3Q99687 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
MEIS3Q99687 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MEIS3Q99687 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MEIS3Q99687 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MEIS3Q99687 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MEIS3Q99687 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MEIS3Q99687 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MEIS3Q99687 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms