Protein–RNA interactions for Protein: Q99460

PSMD1, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD1Q99460 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSMD1Q99460 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSMD1Q99460 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PSMD1Q99460 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSMD1Q99460 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PSMD1Q99460 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSMD1Q99460 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSMD1Q99460 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSMD1Q99460 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSMD1Q99460 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSMD1Q99460 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSMD1Q99460 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSMD1Q99460 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSMD1Q99460 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSMD1Q99460 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSMD1Q99460 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSMD1Q99460 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSMD1Q99460 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSMD1Q99460 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSMD1Q99460 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSMD1Q99460 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PSMD1Q99460 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PSMD1Q99460 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSMD1Q99460 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSMD1Q99460 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PSMD1Q99460 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSMD1Q99460 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSMD1Q99460 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSMD1Q99460 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSMD1Q99460 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSMD1Q99460 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSMD1Q99460 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSMD1Q99460 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PSMD1Q99460 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PSMD1Q99460 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PSMD1Q99460 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PSMD1Q99460 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSMD1Q99460 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PSMD1Q99460 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PSMD1Q99460 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSMD1Q99460 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSMD1Q99460 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSMD1Q99460 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSMD1Q99460 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSMD1Q99460 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSMD1Q99460 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSMD1Q99460 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSMD1Q99460 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSMD1Q99460 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMD1Q99460 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMD1Q99460 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMD1Q99460 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMD1Q99460 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMD1Q99460 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMD1Q99460 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMD1Q99460 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMD1Q99460 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMD1Q99460 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMD1Q99460 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMD1Q99460 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMD1Q99460 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMD1Q99460 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMD1Q99460 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMD1Q99460 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSMD1Q99460 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSMD1Q99460 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSMD1Q99460 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSMD1Q99460 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSMD1Q99460 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSMD1Q99460 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSMD1Q99460 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSMD1Q99460 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSMD1Q99460 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PSMD1Q99460 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSMD1Q99460 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PSMD1Q99460 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSMD1Q99460 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PSMD1Q99460 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSMD1Q99460 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSMD1Q99460 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSMD1Q99460 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSMD1Q99460 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSMD1Q99460 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PSMD1Q99460 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSMD1Q99460 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSMD1Q99460 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSMD1Q99460 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSMD1Q99460 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSMD1Q99460 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSMD1Q99460 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSMD1Q99460 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSMD1Q99460 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSMD1Q99460 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSMD1Q99460 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSMD1Q99460 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSMD1Q99460 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSMD1Q99460 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSMD1Q99460 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSMD1Q99460 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSMD1Q99460 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms