Protein–RNA interactions for Protein: Q96S21

RAB40C, Ras-related protein Rab-40C, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40CQ96S21 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB40CQ96S21 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB40CQ96S21 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB40CQ96S21 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB40CQ96S21 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB40CQ96S21 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB40CQ96S21 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB40CQ96S21 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB40CQ96S21 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB40CQ96S21 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB40CQ96S21 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB40CQ96S21 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB40CQ96S21 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB40CQ96S21 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB40CQ96S21 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB40CQ96S21 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB40CQ96S21 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB40CQ96S21 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB40CQ96S21 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB40CQ96S21 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB40CQ96S21 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB40CQ96S21 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB40CQ96S21 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB40CQ96S21 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB40CQ96S21 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB40CQ96S21 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB40CQ96S21 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB40CQ96S21 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB40CQ96S21 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB40CQ96S21 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB40CQ96S21 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB40CQ96S21 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB40CQ96S21 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB40CQ96S21 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB40CQ96S21 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB40CQ96S21 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB40CQ96S21 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB40CQ96S21 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB40CQ96S21 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB40CQ96S21 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB40CQ96S21 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB40CQ96S21 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB40CQ96S21 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB40CQ96S21 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB40CQ96S21 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB40CQ96S21 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB40CQ96S21 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB40CQ96S21 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB40CQ96S21 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB40CQ96S21 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB40CQ96S21 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB40CQ96S21 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB40CQ96S21 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB40CQ96S21 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB40CQ96S21 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB40CQ96S21 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB40CQ96S21 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB40CQ96S21 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB40CQ96S21 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB40CQ96S21 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB40CQ96S21 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB40CQ96S21 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB40CQ96S21 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB40CQ96S21 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB40CQ96S21 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB40CQ96S21 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB40CQ96S21 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB40CQ96S21 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB40CQ96S21 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB40CQ96S21 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB40CQ96S21 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB40CQ96S21 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB40CQ96S21 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB40CQ96S21 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB40CQ96S21 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB40CQ96S21 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB40CQ96S21 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB40CQ96S21 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB40CQ96S21 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB40CQ96S21 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB40CQ96S21 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB40CQ96S21 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB40CQ96S21 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB40CQ96S21 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB40CQ96S21 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB40CQ96S21 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB40CQ96S21 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB40CQ96S21 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB40CQ96S21 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB40CQ96S21 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB40CQ96S21 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB40CQ96S21 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB40CQ96S21 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB40CQ96S21 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB40CQ96S21 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB40CQ96S21 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB40CQ96S21 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB40CQ96S21 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB40CQ96S21 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB40CQ96S21 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.9 ms