Protein–RNA interactions for Protein: Q96PR1

KCNC2, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 2, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC2Q96PR1 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNC2Q96PR1 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNC2Q96PR1 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNC2Q96PR1 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNC2Q96PR1 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNC2Q96PR1 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNC2Q96PR1 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNC2Q96PR1 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNC2Q96PR1 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNC2Q96PR1 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNC2Q96PR1 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNC2Q96PR1 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNC2Q96PR1 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNC2Q96PR1 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNC2Q96PR1 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNC2Q96PR1 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNC2Q96PR1 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNC2Q96PR1 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNC2Q96PR1 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNC2Q96PR1 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNC2Q96PR1 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNC2Q96PR1 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNC2Q96PR1 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNC2Q96PR1 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNC2Q96PR1 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNC2Q96PR1 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNC2Q96PR1 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNC2Q96PR1 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNC2Q96PR1 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNC2Q96PR1 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNC2Q96PR1 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNC2Q96PR1 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNC2Q96PR1 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNC2Q96PR1 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNC2Q96PR1 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms