Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP9

GBP4, Guanylate-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP4Q96PP9 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GBP4Q96PP9 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GBP4Q96PP9 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GBP4Q96PP9 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GBP4Q96PP9 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GBP4Q96PP9 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GBP4Q96PP9 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GBP4Q96PP9 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GBP4Q96PP9 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GBP4Q96PP9 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GBP4Q96PP9 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GBP4Q96PP9 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GBP4Q96PP9 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GBP4Q96PP9 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GBP4Q96PP9 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GBP4Q96PP9 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GBP4Q96PP9 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GBP4Q96PP9 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GBP4Q96PP9 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GBP4Q96PP9 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GBP4Q96PP9 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GBP4Q96PP9 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GBP4Q96PP9 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GBP4Q96PP9 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GBP4Q96PP9 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GBP4Q96PP9 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GBP4Q96PP9 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GBP4Q96PP9 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GBP4Q96PP9 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GBP4Q96PP9 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GBP4Q96PP9 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GBP4Q96PP9 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GBP4Q96PP9 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GBP4Q96PP9 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GBP4Q96PP9 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GBP4Q96PP9 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GBP4Q96PP9 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GBP4Q96PP9 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GBP4Q96PP9 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GBP4Q96PP9 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GBP4Q96PP9 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GBP4Q96PP9 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GBP4Q96PP9 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GBP4Q96PP9 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GBP4Q96PP9 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GBP4Q96PP9 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GBP4Q96PP9 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GBP4Q96PP9 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GBP4Q96PP9 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GBP4Q96PP9 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GBP4Q96PP9 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GBP4Q96PP9 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GBP4Q96PP9 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GBP4Q96PP9 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GBP4Q96PP9 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GBP4Q96PP9 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GBP4Q96PP9 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GBP4Q96PP9 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GBP4Q96PP9 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GBP4Q96PP9 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GBP4Q96PP9 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GBP4Q96PP9 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GBP4Q96PP9 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GBP4Q96PP9 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GBP4Q96PP9 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GBP4Q96PP9 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GBP4Q96PP9 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GBP4Q96PP9 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GBP4Q96PP9 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GBP4Q96PP9 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms