Protein–RNA interactions for Protein: Q96LX7

CCDC17, Coiled-coil domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC17Q96LX7 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC17Q96LX7 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC17Q96LX7 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC17Q96LX7 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC17Q96LX7 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC17Q96LX7 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC17Q96LX7 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC17Q96LX7 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC17Q96LX7 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC17Q96LX7 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC17Q96LX7 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC17Q96LX7 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC17Q96LX7 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC17Q96LX7 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC17Q96LX7 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC17Q96LX7 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC17Q96LX7 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC17Q96LX7 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC17Q96LX7 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC17Q96LX7 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC17Q96LX7 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC17Q96LX7 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC17Q96LX7 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC17Q96LX7 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC17Q96LX7 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC17Q96LX7 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC17Q96LX7 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC17Q96LX7 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC17Q96LX7 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC17Q96LX7 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC17Q96LX7 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC17Q96LX7 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC17Q96LX7 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC17Q96LX7 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC17Q96LX7 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC17Q96LX7 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC17Q96LX7 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC17Q96LX7 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC17Q96LX7 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC17Q96LX7 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC17Q96LX7 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC17Q96LX7 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC17Q96LX7 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC17Q96LX7 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC17Q96LX7 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC17Q96LX7 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC17Q96LX7 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC17Q96LX7 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC17Q96LX7 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC17Q96LX7 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC17Q96LX7 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC17Q96LX7 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC17Q96LX7 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC17Q96LX7 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC17Q96LX7 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC17Q96LX7 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC17Q96LX7 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC17Q96LX7 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC17Q96LX7 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC17Q96LX7 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC17Q96LX7 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC17Q96LX7 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC17Q96LX7 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC17Q96LX7 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC17Q96LX7 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC17Q96LX7 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC17Q96LX7 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC17Q96LX7 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC17Q96LX7 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCDC17Q96LX7 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC17Q96LX7 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC17Q96LX7 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC17Q96LX7 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC17Q96LX7 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC17Q96LX7 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC17Q96LX7 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC17Q96LX7 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC17Q96LX7 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC17Q96LX7 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC17Q96LX7 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC17Q96LX7 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC17Q96LX7 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC17Q96LX7 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC17Q96LX7 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC17Q96LX7 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC17Q96LX7 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC17Q96LX7 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC17Q96LX7 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC17Q96LX7 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC17Q96LX7 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC17Q96LX7 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC17Q96LX7 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC17Q96LX7 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC17Q96LX7 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC17Q96LX7 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC17Q96LX7 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC17Q96LX7 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC17Q96LX7 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC17Q96LX7 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC17Q96LX7 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms