Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms