Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF2

PRAC1, Small nuclear protein PRAC1, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAC1Q96KF2 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC9.29□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC9.28□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC9.28□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC9.28□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms