Protein–RNA interactions for Protein: Q96JS3

PGBD1, PiggyBac transposable element-derived protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD1Q96JS3 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms