Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ5

MS4A4A, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4A, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A4AQ96JQ5 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MS4A4AQ96JQ5 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MS4A4AQ96JQ5 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MS4A4AQ96JQ5 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MS4A4AQ96JQ5 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MS4A4AQ96JQ5 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MS4A4AQ96JQ5 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MS4A4AQ96JQ5 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
MS4A4AQ96JQ5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MS4A4AQ96JQ5 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MS4A4AQ96JQ5 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
MS4A4AQ96JQ5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MS4A4AQ96JQ5 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MS4A4AQ96JQ5 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MS4A4AQ96JQ5 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MS4A4AQ96JQ5 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MS4A4AQ96JQ5 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MS4A4AQ96JQ5 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MS4A4AQ96JQ5 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MS4A4AQ96JQ5 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MS4A4AQ96JQ5 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MS4A4AQ96JQ5 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MS4A4AQ96JQ5 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MS4A4AQ96JQ5 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MS4A4AQ96JQ5 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MS4A4AQ96JQ5 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
MS4A4AQ96JQ5 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MS4A4AQ96JQ5 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MS4A4AQ96JQ5 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MS4A4AQ96JQ5 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MS4A4AQ96JQ5 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
MS4A4AQ96JQ5 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MS4A4AQ96JQ5 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MS4A4AQ96JQ5 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MS4A4AQ96JQ5 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MS4A4AQ96JQ5 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MS4A4AQ96JQ5 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MS4A4AQ96JQ5 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
MS4A4AQ96JQ5 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MS4A4AQ96JQ5 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MS4A4AQ96JQ5 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MS4A4AQ96JQ5 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MS4A4AQ96JQ5 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MS4A4AQ96JQ5 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MS4A4AQ96JQ5 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MS4A4AQ96JQ5 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MS4A4AQ96JQ5 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MS4A4AQ96JQ5 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MS4A4AQ96JQ5 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MS4A4AQ96JQ5 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
MS4A4AQ96JQ5 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
MS4A4AQ96JQ5 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MS4A4AQ96JQ5 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MS4A4AQ96JQ5 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MS4A4AQ96JQ5 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MS4A4AQ96JQ5 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MS4A4AQ96JQ5 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MS4A4AQ96JQ5 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MS4A4AQ96JQ5 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MS4A4AQ96JQ5 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MS4A4AQ96JQ5 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MS4A4AQ96JQ5 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MS4A4AQ96JQ5 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MS4A4AQ96JQ5 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MS4A4AQ96JQ5 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MS4A4AQ96JQ5 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MS4A4AQ96JQ5 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MS4A4AQ96JQ5 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MS4A4AQ96JQ5 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MS4A4AQ96JQ5 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MS4A4AQ96JQ5 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
MS4A4AQ96JQ5 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
MS4A4AQ96JQ5 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
MS4A4AQ96JQ5 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MS4A4AQ96JQ5 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MS4A4AQ96JQ5 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
MS4A4AQ96JQ5 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MS4A4AQ96JQ5 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MS4A4AQ96JQ5 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MS4A4AQ96JQ5 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MS4A4AQ96JQ5 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MS4A4AQ96JQ5 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MS4A4AQ96JQ5 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MS4A4AQ96JQ5 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
MS4A4AQ96JQ5 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MS4A4AQ96JQ5 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MS4A4AQ96JQ5 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MS4A4AQ96JQ5 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MS4A4AQ96JQ5 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MS4A4AQ96JQ5 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MS4A4AQ96JQ5 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MS4A4AQ96JQ5 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
MS4A4AQ96JQ5 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MS4A4AQ96JQ5 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MS4A4AQ96JQ5 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MS4A4AQ96JQ5 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MS4A4AQ96JQ5 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
MS4A4AQ96JQ5 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MS4A4AQ96JQ5 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MS4A4AQ96JQ5 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms