Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM3

CHAMP1, Chromosome alignment-maintaining phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAMP1Q96JM3 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms