Protein–RNA interactions for Protein: Q96H15

TIMD4, T-cell immunoglobulin and mucin domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMD4Q96H15 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TIMD4Q96H15 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TIMD4Q96H15 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TIMD4Q96H15 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TIMD4Q96H15 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TIMD4Q96H15 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TIMD4Q96H15 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TIMD4Q96H15 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TIMD4Q96H15 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TIMD4Q96H15 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TIMD4Q96H15 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TIMD4Q96H15 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TIMD4Q96H15 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TIMD4Q96H15 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TIMD4Q96H15 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TIMD4Q96H15 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TIMD4Q96H15 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TIMD4Q96H15 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TIMD4Q96H15 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TIMD4Q96H15 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TIMD4Q96H15 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TIMD4Q96H15 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TIMD4Q96H15 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TIMD4Q96H15 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TIMD4Q96H15 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TIMD4Q96H15 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TIMD4Q96H15 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TIMD4Q96H15 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TIMD4Q96H15 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TIMD4Q96H15 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TIMD4Q96H15 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMD4Q96H15 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMD4Q96H15 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMD4Q96H15 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMD4Q96H15 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMD4Q96H15 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMD4Q96H15 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMD4Q96H15 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMD4Q96H15 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMD4Q96H15 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMD4Q96H15 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMD4Q96H15 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMD4Q96H15 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMD4Q96H15 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMD4Q96H15 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMD4Q96H15 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMD4Q96H15 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMD4Q96H15 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMD4Q96H15 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMD4Q96H15 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMD4Q96H15 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMD4Q96H15 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMD4Q96H15 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMD4Q96H15 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMD4Q96H15 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMD4Q96H15 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMD4Q96H15 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMD4Q96H15 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMD4Q96H15 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMD4Q96H15 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMD4Q96H15 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMD4Q96H15 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMD4Q96H15 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMD4Q96H15 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMD4Q96H15 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMD4Q96H15 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMD4Q96H15 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMD4Q96H15 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMD4Q96H15 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMD4Q96H15 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMD4Q96H15 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMD4Q96H15 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMD4Q96H15 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMD4Q96H15 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMD4Q96H15 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMD4Q96H15 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMD4Q96H15 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMD4Q96H15 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMD4Q96H15 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMD4Q96H15 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMD4Q96H15 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMD4Q96H15 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMD4Q96H15 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMD4Q96H15 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMD4Q96H15 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMD4Q96H15 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMD4Q96H15 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMD4Q96H15 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMD4Q96H15 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMD4Q96H15 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMD4Q96H15 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMD4Q96H15 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMD4Q96H15 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMD4Q96H15 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMD4Q96H15 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMD4Q96H15 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMD4Q96H15 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMD4Q96H15 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMD4Q96H15 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMD4Q96H15 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms