Protein–RNA interactions for Protein: Q96GP6

SCARF2, Scavenger receptor class F member 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF2Q96GP6 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCARF2Q96GP6 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCARF2Q96GP6 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCARF2Q96GP6 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCARF2Q96GP6 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCARF2Q96GP6 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCARF2Q96GP6 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SCARF2Q96GP6 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SCARF2Q96GP6 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCARF2Q96GP6 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCARF2Q96GP6 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCARF2Q96GP6 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCARF2Q96GP6 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCARF2Q96GP6 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCARF2Q96GP6 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms