Protein–RNA interactions for Protein: Q96EU6

RRP36, Ribosomal RNA processing protein 36 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP36Q96EU6 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RRP36Q96EU6 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RRP36Q96EU6 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RRP36Q96EU6 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RRP36Q96EU6 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RRP36Q96EU6 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RRP36Q96EU6 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RRP36Q96EU6 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RRP36Q96EU6 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RRP36Q96EU6 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RRP36Q96EU6 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RRP36Q96EU6 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RRP36Q96EU6 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RRP36Q96EU6 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RRP36Q96EU6 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RRP36Q96EU6 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RRP36Q96EU6 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RRP36Q96EU6 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RRP36Q96EU6 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RRP36Q96EU6 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RRP36Q96EU6 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RRP36Q96EU6 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RRP36Q96EU6 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RRP36Q96EU6 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RRP36Q96EU6 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RRP36Q96EU6 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RRP36Q96EU6 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RRP36Q96EU6 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RRP36Q96EU6 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RRP36Q96EU6 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RRP36Q96EU6 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RRP36Q96EU6 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RRP36Q96EU6 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RRP36Q96EU6 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RRP36Q96EU6 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RRP36Q96EU6 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RRP36Q96EU6 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RRP36Q96EU6 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RRP36Q96EU6 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RRP36Q96EU6 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RRP36Q96EU6 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RRP36Q96EU6 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RRP36Q96EU6 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RRP36Q96EU6 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RRP36Q96EU6 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RRP36Q96EU6 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RRP36Q96EU6 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RRP36Q96EU6 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RRP36Q96EU6 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RRP36Q96EU6 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RRP36Q96EU6 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RRP36Q96EU6 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RRP36Q96EU6 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RRP36Q96EU6 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RRP36Q96EU6 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RRP36Q96EU6 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RRP36Q96EU6 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RRP36Q96EU6 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RRP36Q96EU6 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RRP36Q96EU6 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RRP36Q96EU6 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RRP36Q96EU6 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RRP36Q96EU6 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RRP36Q96EU6 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RRP36Q96EU6 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RRP36Q96EU6 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RRP36Q96EU6 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RRP36Q96EU6 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RRP36Q96EU6 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RRP36Q96EU6 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RRP36Q96EU6 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RRP36Q96EU6 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RRP36Q96EU6 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RRP36Q96EU6 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RRP36Q96EU6 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RRP36Q96EU6 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RRP36Q96EU6 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RRP36Q96EU6 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RRP36Q96EU6 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RRP36Q96EU6 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RRP36Q96EU6 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RRP36Q96EU6 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RRP36Q96EU6 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RRP36Q96EU6 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RRP36Q96EU6 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RRP36Q96EU6 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RRP36Q96EU6 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RRP36Q96EU6 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RRP36Q96EU6 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RRP36Q96EU6 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RRP36Q96EU6 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RRP36Q96EU6 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RRP36Q96EU6 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RRP36Q96EU6 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RRP36Q96EU6 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RRP36Q96EU6 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RRP36Q96EU6 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RRP36Q96EU6 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RRP36Q96EU6 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RRP36Q96EU6 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms