Protein–RNA interactions for Protein: Q96ER9

CCDC51, Coiled-coil domain-containing protein 51, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC51Q96ER9 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms