Protein–RNA interactions for Protein: Q96A61

TRIM52, Tripartite motif-containing protein 52, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM52Q96A61 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRIM52Q96A61 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRIM52Q96A61 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRIM52Q96A61 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRIM52Q96A61 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRIM52Q96A61 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRIM52Q96A61 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRIM52Q96A61 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRIM52Q96A61 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRIM52Q96A61 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRIM52Q96A61 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRIM52Q96A61 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
TRIM52Q96A61 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRIM52Q96A61 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRIM52Q96A61 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
TRIM52Q96A61 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRIM52Q96A61 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
TRIM52Q96A61 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRIM52Q96A61 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRIM52Q96A61 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRIM52Q96A61 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRIM52Q96A61 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRIM52Q96A61 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRIM52Q96A61 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRIM52Q96A61 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRIM52Q96A61 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRIM52Q96A61 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRIM52Q96A61 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRIM52Q96A61 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRIM52Q96A61 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRIM52Q96A61 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRIM52Q96A61 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRIM52Q96A61 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRIM52Q96A61 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRIM52Q96A61 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRIM52Q96A61 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRIM52Q96A61 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRIM52Q96A61 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRIM52Q96A61 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRIM52Q96A61 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRIM52Q96A61 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRIM52Q96A61 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRIM52Q96A61 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
TRIM52Q96A61 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRIM52Q96A61 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
TRIM52Q96A61 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRIM52Q96A61 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRIM52Q96A61 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRIM52Q96A61 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRIM52Q96A61 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRIM52Q96A61 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRIM52Q96A61 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRIM52Q96A61 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRIM52Q96A61 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRIM52Q96A61 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRIM52Q96A61 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRIM52Q96A61 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRIM52Q96A61 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRIM52Q96A61 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRIM52Q96A61 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRIM52Q96A61 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRIM52Q96A61 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRIM52Q96A61 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRIM52Q96A61 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRIM52Q96A61 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRIM52Q96A61 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRIM52Q96A61 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRIM52Q96A61 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRIM52Q96A61 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRIM52Q96A61 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRIM52Q96A61 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRIM52Q96A61 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRIM52Q96A61 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRIM52Q96A61 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRIM52Q96A61 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRIM52Q96A61 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRIM52Q96A61 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
TRIM52Q96A61 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRIM52Q96A61 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRIM52Q96A61 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRIM52Q96A61 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRIM52Q96A61 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRIM52Q96A61 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRIM52Q96A61 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRIM52Q96A61 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRIM52Q96A61 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRIM52Q96A61 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRIM52Q96A61 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRIM52Q96A61 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
TRIM52Q96A61 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRIM52Q96A61 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRIM52Q96A61 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRIM52Q96A61 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRIM52Q96A61 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRIM52Q96A61 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
TRIM52Q96A61 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
TRIM52Q96A61 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRIM52Q96A61 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRIM52Q96A61 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRIM52Q96A61 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms