Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUT4

LRRN4, Leucine-rich repeat neuronal protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN4Q8WUT4 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LRRN4Q8WUT4 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LRRN4Q8WUT4 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LRRN4Q8WUT4 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LRRN4Q8WUT4 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LRRN4Q8WUT4 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LRRN4Q8WUT4 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LRRN4Q8WUT4 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LRRN4Q8WUT4 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LRRN4Q8WUT4 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LRRN4Q8WUT4 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LRRN4Q8WUT4 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LRRN4Q8WUT4 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LRRN4Q8WUT4 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LRRN4Q8WUT4 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
LRRN4Q8WUT4 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LRRN4Q8WUT4 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
LRRN4Q8WUT4 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LRRN4Q8WUT4 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LRRN4Q8WUT4 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LRRN4Q8WUT4 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LRRN4Q8WUT4 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LRRN4Q8WUT4 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LRRN4Q8WUT4 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LRRN4Q8WUT4 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LRRN4Q8WUT4 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LRRN4Q8WUT4 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LRRN4Q8WUT4 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LRRN4Q8WUT4 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
LRRN4Q8WUT4 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LRRN4Q8WUT4 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LRRN4Q8WUT4 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LRRN4Q8WUT4 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LRRN4Q8WUT4 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LRRN4Q8WUT4 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LRRN4Q8WUT4 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LRRN4Q8WUT4 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LRRN4Q8WUT4 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LRRN4Q8WUT4 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LRRN4Q8WUT4 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LRRN4Q8WUT4 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LRRN4Q8WUT4 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LRRN4Q8WUT4 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LRRN4Q8WUT4 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LRRN4Q8WUT4 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LRRN4Q8WUT4 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LRRN4Q8WUT4 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
LRRN4Q8WUT4 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
LRRN4Q8WUT4 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LRRN4Q8WUT4 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LRRN4Q8WUT4 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LRRN4Q8WUT4 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
LRRN4Q8WUT4 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LRRN4Q8WUT4 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
LRRN4Q8WUT4 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LRRN4Q8WUT4 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LRRN4Q8WUT4 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LRRN4Q8WUT4 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LRRN4Q8WUT4 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LRRN4Q8WUT4 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LRRN4Q8WUT4 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LRRN4Q8WUT4 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LRRN4Q8WUT4 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
LRRN4Q8WUT4 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
LRRN4Q8WUT4 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LRRN4Q8WUT4 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LRRN4Q8WUT4 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LRRN4Q8WUT4 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
LRRN4Q8WUT4 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LRRN4Q8WUT4 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LRRN4Q8WUT4 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LRRN4Q8WUT4 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LRRN4Q8WUT4 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LRRN4Q8WUT4 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LRRN4Q8WUT4 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LRRN4Q8WUT4 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LRRN4Q8WUT4 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LRRN4Q8WUT4 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LRRN4Q8WUT4 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LRRN4Q8WUT4 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LRRN4Q8WUT4 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LRRN4Q8WUT4 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LRRN4Q8WUT4 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LRRN4Q8WUT4 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LRRN4Q8WUT4 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LRRN4Q8WUT4 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
LRRN4Q8WUT4 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
LRRN4Q8WUT4 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
LRRN4Q8WUT4 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LRRN4Q8WUT4 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LRRN4Q8WUT4 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
LRRN4Q8WUT4 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LRRN4Q8WUT4 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LRRN4Q8WUT4 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
LRRN4Q8WUT4 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LRRN4Q8WUT4 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LRRN4Q8WUT4 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LRRN4Q8WUT4 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LRRN4Q8WUT4 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LRRN4Q8WUT4 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms