Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC12Q8WUD4 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC12Q8WUD4 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC12Q8WUD4 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC12Q8WUD4 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC12Q8WUD4 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC12Q8WUD4 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC12Q8WUD4 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC12Q8WUD4 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC12Q8WUD4 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC12Q8WUD4 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC12Q8WUD4 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC12Q8WUD4 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC12Q8WUD4 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC12Q8WUD4 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC12Q8WUD4 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC12Q8WUD4 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC12Q8WUD4 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC12Q8WUD4 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC12Q8WUD4 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC12Q8WUD4 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC12Q8WUD4 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC12Q8WUD4 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC12Q8WUD4 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC12Q8WUD4 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC12Q8WUD4 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC12Q8WUD4 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC12Q8WUD4 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC12Q8WUD4 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC12Q8WUD4 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC12Q8WUD4 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC12Q8WUD4 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC12Q8WUD4 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC12Q8WUD4 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC12Q8WUD4 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC12Q8WUD4 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC12Q8WUD4 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC12Q8WUD4 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC12Q8WUD4 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC12Q8WUD4 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC12Q8WUD4 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC12Q8WUD4 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC12Q8WUD4 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC12Q8WUD4 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC12Q8WUD4 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC12Q8WUD4 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC12Q8WUD4 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC12Q8WUD4 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC12Q8WUD4 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC12Q8WUD4 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC12Q8WUD4 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC12Q8WUD4 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC12Q8WUD4 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC12Q8WUD4 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC12Q8WUD4 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC12Q8WUD4 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC12Q8WUD4 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC12Q8WUD4 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC12Q8WUD4 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC12Q8WUD4 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC12Q8WUD4 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC12Q8WUD4 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC12Q8WUD4 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC12Q8WUD4 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC12Q8WUD4 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC12Q8WUD4 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC12Q8WUD4 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC12Q8WUD4 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC12Q8WUD4 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC12Q8WUD4 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC12Q8WUD4 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC12Q8WUD4 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC12Q8WUD4 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC12Q8WUD4 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC12Q8WUD4 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC12Q8WUD4 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC12Q8WUD4 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC12Q8WUD4 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC12Q8WUD4 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC12Q8WUD4 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC12Q8WUD4 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC12Q8WUD4 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC12Q8WUD4 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC12Q8WUD4 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC12Q8WUD4 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC12Q8WUD4 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC12Q8WUD4 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC12Q8WUD4 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC12Q8WUD4 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC12Q8WUD4 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC12Q8WUD4 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC12Q8WUD4 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC12Q8WUD4 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC12Q8WUD4 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC12Q8WUD4 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC12Q8WUD4 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC12Q8WUD4 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC12Q8WUD4 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC12Q8WUD4 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC12Q8WUD4 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms