Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX29Q8TEQ0 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX29Q8TEQ0 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX29Q8TEQ0 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX29Q8TEQ0 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX29Q8TEQ0 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX29Q8TEQ0 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX29Q8TEQ0 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX29Q8TEQ0 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX29Q8TEQ0 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX29Q8TEQ0 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX29Q8TEQ0 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX29Q8TEQ0 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX29Q8TEQ0 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX29Q8TEQ0 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX29Q8TEQ0 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX29Q8TEQ0 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX29Q8TEQ0 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX29Q8TEQ0 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX29Q8TEQ0 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX29Q8TEQ0 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX29Q8TEQ0 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX29Q8TEQ0 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX29Q8TEQ0 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX29Q8TEQ0 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX29Q8TEQ0 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX29Q8TEQ0 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX29Q8TEQ0 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX29Q8TEQ0 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX29Q8TEQ0 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX29Q8TEQ0 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX29Q8TEQ0 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX29Q8TEQ0 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX29Q8TEQ0 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX29Q8TEQ0 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX29Q8TEQ0 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX29Q8TEQ0 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX29Q8TEQ0 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX29Q8TEQ0 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX29Q8TEQ0 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX29Q8TEQ0 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX29Q8TEQ0 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX29Q8TEQ0 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX29Q8TEQ0 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX29Q8TEQ0 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX29Q8TEQ0 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX29Q8TEQ0 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX29Q8TEQ0 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX29Q8TEQ0 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX29Q8TEQ0 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX29Q8TEQ0 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX29Q8TEQ0 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX29Q8TEQ0 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX29Q8TEQ0 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX29Q8TEQ0 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX29Q8TEQ0 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX29Q8TEQ0 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX29Q8TEQ0 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX29Q8TEQ0 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX29Q8TEQ0 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX29Q8TEQ0 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX29Q8TEQ0 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX29Q8TEQ0 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX29Q8TEQ0 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX29Q8TEQ0 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX29Q8TEQ0 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX29Q8TEQ0 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX29Q8TEQ0 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX29Q8TEQ0 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX29Q8TEQ0 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX29Q8TEQ0 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX29Q8TEQ0 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX29Q8TEQ0 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX29Q8TEQ0 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX29Q8TEQ0 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX29Q8TEQ0 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX29Q8TEQ0 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX29Q8TEQ0 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX29Q8TEQ0 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX29Q8TEQ0 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX29Q8TEQ0 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX29Q8TEQ0 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX29Q8TEQ0 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX29Q8TEQ0 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms