Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEJ3

SH3RF3, SH3 domain-containing RING finger protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3RF3Q8TEJ3 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SH3RF3Q8TEJ3 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SH3RF3Q8TEJ3 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SH3RF3Q8TEJ3 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SH3RF3Q8TEJ3 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SH3RF3Q8TEJ3 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SH3RF3Q8TEJ3 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SH3RF3Q8TEJ3 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SH3RF3Q8TEJ3 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SH3RF3Q8TEJ3 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SH3RF3Q8TEJ3 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SH3RF3Q8TEJ3 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SH3RF3Q8TEJ3 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SH3RF3Q8TEJ3 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SH3RF3Q8TEJ3 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SH3RF3Q8TEJ3 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SH3RF3Q8TEJ3 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SH3RF3Q8TEJ3 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SH3RF3Q8TEJ3 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SH3RF3Q8TEJ3 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SH3RF3Q8TEJ3 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SH3RF3Q8TEJ3 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SH3RF3Q8TEJ3 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SH3RF3Q8TEJ3 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SH3RF3Q8TEJ3 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SH3RF3Q8TEJ3 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SH3RF3Q8TEJ3 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SH3RF3Q8TEJ3 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SH3RF3Q8TEJ3 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SH3RF3Q8TEJ3 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SH3RF3Q8TEJ3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SH3RF3Q8TEJ3 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SH3RF3Q8TEJ3 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SH3RF3Q8TEJ3 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SH3RF3Q8TEJ3 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SH3RF3Q8TEJ3 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SH3RF3Q8TEJ3 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SH3RF3Q8TEJ3 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH3RF3Q8TEJ3 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH3RF3Q8TEJ3 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH3RF3Q8TEJ3 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH3RF3Q8TEJ3 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH3RF3Q8TEJ3 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH3RF3Q8TEJ3 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SH3RF3Q8TEJ3 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH3RF3Q8TEJ3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH3RF3Q8TEJ3 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SH3RF3Q8TEJ3 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH3RF3Q8TEJ3 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SH3RF3Q8TEJ3 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH3RF3Q8TEJ3 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SH3RF3Q8TEJ3 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH3RF3Q8TEJ3 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH3RF3Q8TEJ3 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH3RF3Q8TEJ3 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH3RF3Q8TEJ3 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH3RF3Q8TEJ3 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH3RF3Q8TEJ3 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH3RF3Q8TEJ3 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH3RF3Q8TEJ3 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SH3RF3Q8TEJ3 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH3RF3Q8TEJ3 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SH3RF3Q8TEJ3 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SH3RF3Q8TEJ3 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SH3RF3Q8TEJ3 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SH3RF3Q8TEJ3 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SH3RF3Q8TEJ3 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SH3RF3Q8TEJ3 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SH3RF3Q8TEJ3 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SH3RF3Q8TEJ3 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SH3RF3Q8TEJ3 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SH3RF3Q8TEJ3 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SH3RF3Q8TEJ3 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SH3RF3Q8TEJ3 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SH3RF3Q8TEJ3 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SH3RF3Q8TEJ3 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SH3RF3Q8TEJ3 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SH3RF3Q8TEJ3 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SH3RF3Q8TEJ3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SH3RF3Q8TEJ3 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SH3RF3Q8TEJ3 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SH3RF3Q8TEJ3 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SH3RF3Q8TEJ3 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SH3RF3Q8TEJ3 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SH3RF3Q8TEJ3 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SH3RF3Q8TEJ3 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SH3RF3Q8TEJ3 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SH3RF3Q8TEJ3 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SH3RF3Q8TEJ3 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SH3RF3Q8TEJ3 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SH3RF3Q8TEJ3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SH3RF3Q8TEJ3 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SH3RF3Q8TEJ3 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SH3RF3Q8TEJ3 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SH3RF3Q8TEJ3 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SH3RF3Q8TEJ3 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SH3RF3Q8TEJ3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SH3RF3Q8TEJ3 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SH3RF3Q8TEJ3 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SH3RF3Q8TEJ3 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms