Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MYRIPQ8NFW9 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MYRIPQ8NFW9 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MYRIPQ8NFW9 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MYRIPQ8NFW9 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MYRIPQ8NFW9 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MYRIPQ8NFW9 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MYRIPQ8NFW9 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MYRIPQ8NFW9 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MYRIPQ8NFW9 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MYRIPQ8NFW9 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
MYRIPQ8NFW9 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MYRIPQ8NFW9 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MYRIPQ8NFW9 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MYRIPQ8NFW9 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MYRIPQ8NFW9 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MYRIPQ8NFW9 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
MYRIPQ8NFW9 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MYRIPQ8NFW9 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MYRIPQ8NFW9 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MYRIPQ8NFW9 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MYRIPQ8NFW9 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MYRIPQ8NFW9 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MYRIPQ8NFW9 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MYRIPQ8NFW9 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MYRIPQ8NFW9 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MYRIPQ8NFW9 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MYRIPQ8NFW9 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MYRIPQ8NFW9 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
MYRIPQ8NFW9 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MYRIPQ8NFW9 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MYRIPQ8NFW9 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MYRIPQ8NFW9 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MYRIPQ8NFW9 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MYRIPQ8NFW9 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MYRIPQ8NFW9 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MYRIPQ8NFW9 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MYRIPQ8NFW9 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
MYRIPQ8NFW9 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
MYRIPQ8NFW9 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MYRIPQ8NFW9 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
MYRIPQ8NFW9 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MYRIPQ8NFW9 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MYRIPQ8NFW9 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MYRIPQ8NFW9 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MYRIPQ8NFW9 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MYRIPQ8NFW9 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MYRIPQ8NFW9 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MYRIPQ8NFW9 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MYRIPQ8NFW9 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MYRIPQ8NFW9 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MYRIPQ8NFW9 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MYRIPQ8NFW9 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MYRIPQ8NFW9 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MYRIPQ8NFW9 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MYRIPQ8NFW9 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MYRIPQ8NFW9 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MYRIPQ8NFW9 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MYRIPQ8NFW9 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MYRIPQ8NFW9 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MYRIPQ8NFW9 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MYRIPQ8NFW9 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MYRIPQ8NFW9 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MYRIPQ8NFW9 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MYRIPQ8NFW9 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MYRIPQ8NFW9 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MYRIPQ8NFW9 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MYRIPQ8NFW9 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MYRIPQ8NFW9 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MYRIPQ8NFW9 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MYRIPQ8NFW9 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MYRIPQ8NFW9 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MYRIPQ8NFW9 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MYRIPQ8NFW9 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MYRIPQ8NFW9 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MYRIPQ8NFW9 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MYRIPQ8NFW9 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MYRIPQ8NFW9 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MYRIPQ8NFW9 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MYRIPQ8NFW9 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MYRIPQ8NFW9 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
MYRIPQ8NFW9 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MYRIPQ8NFW9 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MYRIPQ8NFW9 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MYRIPQ8NFW9 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MYRIPQ8NFW9 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MYRIPQ8NFW9 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MYRIPQ8NFW9 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
MYRIPQ8NFW9 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MYRIPQ8NFW9 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MYRIPQ8NFW9 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MYRIPQ8NFW9 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MYRIPQ8NFW9 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MYRIPQ8NFW9 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MYRIPQ8NFW9 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MYRIPQ8NFW9 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MYRIPQ8NFW9 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MYRIPQ8NFW9 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MYRIPQ8NFW9 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MYRIPQ8NFW9 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms