Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE01

CNNM3, Metal transporter CNNM3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM3Q8NE01 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNNM3Q8NE01 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNNM3Q8NE01 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNNM3Q8NE01 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CNNM3Q8NE01 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CNNM3Q8NE01 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNNM3Q8NE01 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNNM3Q8NE01 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNNM3Q8NE01 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNNM3Q8NE01 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNNM3Q8NE01 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNNM3Q8NE01 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CNNM3Q8NE01 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNNM3Q8NE01 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNNM3Q8NE01 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNNM3Q8NE01 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNNM3Q8NE01 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNNM3Q8NE01 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNNM3Q8NE01 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNNM3Q8NE01 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNNM3Q8NE01 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNNM3Q8NE01 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNNM3Q8NE01 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNNM3Q8NE01 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNNM3Q8NE01 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNNM3Q8NE01 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNNM3Q8NE01 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNNM3Q8NE01 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CNNM3Q8NE01 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNNM3Q8NE01 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNNM3Q8NE01 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNNM3Q8NE01 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNNM3Q8NE01 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNNM3Q8NE01 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNNM3Q8NE01 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNNM3Q8NE01 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNNM3Q8NE01 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNNM3Q8NE01 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNNM3Q8NE01 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNNM3Q8NE01 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNNM3Q8NE01 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNNM3Q8NE01 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNNM3Q8NE01 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNNM3Q8NE01 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNNM3Q8NE01 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNNM3Q8NE01 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNNM3Q8NE01 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNNM3Q8NE01 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNNM3Q8NE01 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNNM3Q8NE01 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNNM3Q8NE01 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNNM3Q8NE01 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNNM3Q8NE01 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNNM3Q8NE01 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNNM3Q8NE01 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNNM3Q8NE01 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNNM3Q8NE01 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNNM3Q8NE01 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNNM3Q8NE01 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNNM3Q8NE01 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNNM3Q8NE01 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNNM3Q8NE01 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNNM3Q8NE01 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNNM3Q8NE01 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNNM3Q8NE01 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNNM3Q8NE01 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNNM3Q8NE01 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNNM3Q8NE01 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNNM3Q8NE01 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNNM3Q8NE01 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNNM3Q8NE01 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNNM3Q8NE01 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CNNM3Q8NE01 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNNM3Q8NE01 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNNM3Q8NE01 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNNM3Q8NE01 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNNM3Q8NE01 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNNM3Q8NE01 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNNM3Q8NE01 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNNM3Q8NE01 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNNM3Q8NE01 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNNM3Q8NE01 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNNM3Q8NE01 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNNM3Q8NE01 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNNM3Q8NE01 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CNNM3Q8NE01 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNNM3Q8NE01 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNNM3Q8NE01 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNNM3Q8NE01 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNNM3Q8NE01 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNNM3Q8NE01 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNNM3Q8NE01 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNNM3Q8NE01 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNNM3Q8NE01 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNNM3Q8NE01 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNNM3Q8NE01 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNNM3Q8NE01 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNNM3Q8NE01 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNNM3Q8NE01 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNNM3Q8NE01 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
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