Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDY6

BHLHE23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE23Q8NDY6 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BHLHE23Q8NDY6 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BHLHE23Q8NDY6 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BHLHE23Q8NDY6 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BHLHE23Q8NDY6 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BHLHE23Q8NDY6 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BHLHE23Q8NDY6 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BHLHE23Q8NDY6 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BHLHE23Q8NDY6 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BHLHE23Q8NDY6 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHLHE23Q8NDY6 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHLHE23Q8NDY6 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHLHE23Q8NDY6 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHLHE23Q8NDY6 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHLHE23Q8NDY6 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHLHE23Q8NDY6 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHLHE23Q8NDY6 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHLHE23Q8NDY6 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHLHE23Q8NDY6 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHLHE23Q8NDY6 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHLHE23Q8NDY6 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHLHE23Q8NDY6 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHLHE23Q8NDY6 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHLHE23Q8NDY6 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHLHE23Q8NDY6 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHLHE23Q8NDY6 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHLHE23Q8NDY6 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHLHE23Q8NDY6 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHLHE23Q8NDY6 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHLHE23Q8NDY6 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHLHE23Q8NDY6 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHLHE23Q8NDY6 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHLHE23Q8NDY6 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHLHE23Q8NDY6 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHLHE23Q8NDY6 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHLHE23Q8NDY6 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHLHE23Q8NDY6 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHLHE23Q8NDY6 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHLHE23Q8NDY6 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHLHE23Q8NDY6 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHLHE23Q8NDY6 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHLHE23Q8NDY6 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHLHE23Q8NDY6 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHLHE23Q8NDY6 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE23Q8NDY6 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE23Q8NDY6 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE23Q8NDY6 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE23Q8NDY6 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE23Q8NDY6 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE23Q8NDY6 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE23Q8NDY6 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE23Q8NDY6 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE23Q8NDY6 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE23Q8NDY6 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE23Q8NDY6 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE23Q8NDY6 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE23Q8NDY6 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE23Q8NDY6 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE23Q8NDY6 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE23Q8NDY6 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE23Q8NDY6 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE23Q8NDY6 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE23Q8NDY6 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE23Q8NDY6 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE23Q8NDY6 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE23Q8NDY6 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE23Q8NDY6 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE23Q8NDY6 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE23Q8NDY6 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE23Q8NDY6 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE23Q8NDY6 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE23Q8NDY6 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE23Q8NDY6 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE23Q8NDY6 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE23Q8NDY6 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE23Q8NDY6 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE23Q8NDY6 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE23Q8NDY6 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE23Q8NDY6 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE23Q8NDY6 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE23Q8NDY6 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE23Q8NDY6 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE23Q8NDY6 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE23Q8NDY6 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE23Q8NDY6 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE23Q8NDY6 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE23Q8NDY6 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BHLHE23Q8NDY6 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
BHLHE23Q8NDY6 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BHLHE23Q8NDY6 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
BHLHE23Q8NDY6 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.25
BHLHE23Q8NDY6 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
BHLHE23Q8NDY6 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BHLHE23Q8NDY6 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms