Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU8

LINC00116, Uncharacterized protein encoded by LINC00116, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00116Q8NCU8 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LINC00116Q8NCU8 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LINC00116Q8NCU8 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LINC00116Q8NCU8 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LINC00116Q8NCU8 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LINC00116Q8NCU8 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LINC00116Q8NCU8 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
LINC00116Q8NCU8 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LINC00116Q8NCU8 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LINC00116Q8NCU8 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LINC00116Q8NCU8 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LINC00116Q8NCU8 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LINC00116Q8NCU8 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LINC00116Q8NCU8 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LINC00116Q8NCU8 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LINC00116Q8NCU8 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LINC00116Q8NCU8 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LINC00116Q8NCU8 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LINC00116Q8NCU8 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LINC00116Q8NCU8 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LINC00116Q8NCU8 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LINC00116Q8NCU8 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LINC00116Q8NCU8 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LINC00116Q8NCU8 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LINC00116Q8NCU8 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LINC00116Q8NCU8 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LINC00116Q8NCU8 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LINC00116Q8NCU8 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LINC00116Q8NCU8 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LINC00116Q8NCU8 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
LINC00116Q8NCU8 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LINC00116Q8NCU8 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LINC00116Q8NCU8 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LINC00116Q8NCU8 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LINC00116Q8NCU8 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LINC00116Q8NCU8 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LINC00116Q8NCU8 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LINC00116Q8NCU8 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LINC00116Q8NCU8 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
LINC00116Q8NCU8 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LINC00116Q8NCU8 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LINC00116Q8NCU8 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LINC00116Q8NCU8 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LINC00116Q8NCU8 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LINC00116Q8NCU8 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LINC00116Q8NCU8 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LINC00116Q8NCU8 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LINC00116Q8NCU8 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LINC00116Q8NCU8 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LINC00116Q8NCU8 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LINC00116Q8NCU8 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LINC00116Q8NCU8 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
LINC00116Q8NCU8 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LINC00116Q8NCU8 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LINC00116Q8NCU8 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LINC00116Q8NCU8 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LINC00116Q8NCU8 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
LINC00116Q8NCU8 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LINC00116Q8NCU8 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LINC00116Q8NCU8 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LINC00116Q8NCU8 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LINC00116Q8NCU8 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LINC00116Q8NCU8 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LINC00116Q8NCU8 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LINC00116Q8NCU8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LINC00116Q8NCU8 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LINC00116Q8NCU8 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LINC00116Q8NCU8 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LINC00116Q8NCU8 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LINC00116Q8NCU8 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LINC00116Q8NCU8 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LINC00116Q8NCU8 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LINC00116Q8NCU8 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
LINC00116Q8NCU8 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LINC00116Q8NCU8 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
LINC00116Q8NCU8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LINC00116Q8NCU8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LINC00116Q8NCU8 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
LINC00116Q8NCU8 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LINC00116Q8NCU8 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LINC00116Q8NCU8 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LINC00116Q8NCU8 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LINC00116Q8NCU8 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LINC00116Q8NCU8 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LINC00116Q8NCU8 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LINC00116Q8NCU8 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LINC00116Q8NCU8 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LINC00116Q8NCU8 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LINC00116Q8NCU8 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LINC00116Q8NCU8 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LINC00116Q8NCU8 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LINC00116Q8NCU8 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LINC00116Q8NCU8 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LINC00116Q8NCU8 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LINC00116Q8NCU8 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LINC00116Q8NCU8 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LINC00116Q8NCU8 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LINC00116Q8NCU8 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LINC00116Q8NCU8 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LINC00116Q8NCU8 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms