Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB12

SMYD1, Histone-lysine N-methyltransferase SMYD1, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD1Q8NB12 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMYD1Q8NB12 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SMYD1Q8NB12 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMYD1Q8NB12 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMYD1Q8NB12 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMYD1Q8NB12 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMYD1Q8NB12 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SMYD1Q8NB12 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMYD1Q8NB12 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMYD1Q8NB12 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMYD1Q8NB12 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMYD1Q8NB12 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMYD1Q8NB12 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMYD1Q8NB12 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMYD1Q8NB12 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMYD1Q8NB12 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMYD1Q8NB12 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMYD1Q8NB12 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMYD1Q8NB12 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMYD1Q8NB12 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SMYD1Q8NB12 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMYD1Q8NB12 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMYD1Q8NB12 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMYD1Q8NB12 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMYD1Q8NB12 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMYD1Q8NB12 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMYD1Q8NB12 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMYD1Q8NB12 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMYD1Q8NB12 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMYD1Q8NB12 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMYD1Q8NB12 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMYD1Q8NB12 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMYD1Q8NB12 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMYD1Q8NB12 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMYD1Q8NB12 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMYD1Q8NB12 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMYD1Q8NB12 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMYD1Q8NB12 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMYD1Q8NB12 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMYD1Q8NB12 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMYD1Q8NB12 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMYD1Q8NB12 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMYD1Q8NB12 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SMYD1Q8NB12 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMYD1Q8NB12 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMYD1Q8NB12 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMYD1Q8NB12 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMYD1Q8NB12 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMYD1Q8NB12 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMYD1Q8NB12 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMYD1Q8NB12 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMYD1Q8NB12 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMYD1Q8NB12 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMYD1Q8NB12 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMYD1Q8NB12 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMYD1Q8NB12 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMYD1Q8NB12 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMYD1Q8NB12 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMYD1Q8NB12 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMYD1Q8NB12 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMYD1Q8NB12 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SMYD1Q8NB12 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SMYD1Q8NB12 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMYD1Q8NB12 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMYD1Q8NB12 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMYD1Q8NB12 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SMYD1Q8NB12 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SMYD1Q8NB12 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SMYD1Q8NB12 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMYD1Q8NB12 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SMYD1Q8NB12 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SMYD1Q8NB12 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SMYD1Q8NB12 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SMYD1Q8NB12 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SMYD1Q8NB12 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SMYD1Q8NB12 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SMYD1Q8NB12 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SMYD1Q8NB12 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMYD1Q8NB12 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SMYD1Q8NB12 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMYD1Q8NB12 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SMYD1Q8NB12 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMYD1Q8NB12 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SMYD1Q8NB12 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMYD1Q8NB12 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMYD1Q8NB12 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMYD1Q8NB12 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMYD1Q8NB12 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMYD1Q8NB12 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SMYD1Q8NB12 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMYD1Q8NB12 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMYD1Q8NB12 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMYD1Q8NB12 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMYD1Q8NB12 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMYD1Q8NB12 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMYD1Q8NB12 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMYD1Q8NB12 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMYD1Q8NB12 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMYD1Q8NB12 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMYD1Q8NB12 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms