Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8Q1

CYB561D1, Cytochrome b561 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYB561D1Q8N8Q1 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CYB561D1Q8N8Q1 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CYB561D1Q8N8Q1 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CYB561D1Q8N8Q1 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CYB561D1Q8N8Q1 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CYB561D1Q8N8Q1 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CYB561D1Q8N8Q1 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CYB561D1Q8N8Q1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CYB561D1Q8N8Q1 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CYB561D1Q8N8Q1 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CYB561D1Q8N8Q1 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CYB561D1Q8N8Q1 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CYB561D1Q8N8Q1 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CYB561D1Q8N8Q1 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CYB561D1Q8N8Q1 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CYB561D1Q8N8Q1 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CYB561D1Q8N8Q1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CYB561D1Q8N8Q1 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CYB561D1Q8N8Q1 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CYB561D1Q8N8Q1 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CYB561D1Q8N8Q1 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CYB561D1Q8N8Q1 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CYB561D1Q8N8Q1 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CYB561D1Q8N8Q1 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CYB561D1Q8N8Q1 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CYB561D1Q8N8Q1 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CYB561D1Q8N8Q1 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CYB561D1Q8N8Q1 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CYB561D1Q8N8Q1 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CYB561D1Q8N8Q1 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CYB561D1Q8N8Q1 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CYB561D1Q8N8Q1 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CYB561D1Q8N8Q1 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CYB561D1Q8N8Q1 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CYB561D1Q8N8Q1 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CYB561D1Q8N8Q1 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CYB561D1Q8N8Q1 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CYB561D1Q8N8Q1 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CYB561D1Q8N8Q1 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CYB561D1Q8N8Q1 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CYB561D1Q8N8Q1 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CYB561D1Q8N8Q1 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CYB561D1Q8N8Q1 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CYB561D1Q8N8Q1 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CYB561D1Q8N8Q1 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CYB561D1Q8N8Q1 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CYB561D1Q8N8Q1 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CYB561D1Q8N8Q1 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CYB561D1Q8N8Q1 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CYB561D1Q8N8Q1 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CYB561D1Q8N8Q1 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CYB561D1Q8N8Q1 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CYB561D1Q8N8Q1 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CYB561D1Q8N8Q1 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CYB561D1Q8N8Q1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CYB561D1Q8N8Q1 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CYB561D1Q8N8Q1 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CYB561D1Q8N8Q1 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CYB561D1Q8N8Q1 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CYB561D1Q8N8Q1 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CYB561D1Q8N8Q1 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CYB561D1Q8N8Q1 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CYB561D1Q8N8Q1 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CYB561D1Q8N8Q1 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CYB561D1Q8N8Q1 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CYB561D1Q8N8Q1 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CYB561D1Q8N8Q1 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CYB561D1Q8N8Q1 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CYB561D1Q8N8Q1 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CYB561D1Q8N8Q1 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CYB561D1Q8N8Q1 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CYB561D1Q8N8Q1 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CYB561D1Q8N8Q1 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CYB561D1Q8N8Q1 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CYB561D1Q8N8Q1 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CYB561D1Q8N8Q1 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CYB561D1Q8N8Q1 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CYB561D1Q8N8Q1 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CYB561D1Q8N8Q1 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CYB561D1Q8N8Q1 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CYB561D1Q8N8Q1 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CYB561D1Q8N8Q1 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
CYB561D1Q8N8Q1 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CYB561D1Q8N8Q1 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CYB561D1Q8N8Q1 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CYB561D1Q8N8Q1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CYB561D1Q8N8Q1 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CYB561D1Q8N8Q1 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CYB561D1Q8N8Q1 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CYB561D1Q8N8Q1 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CYB561D1Q8N8Q1 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CYB561D1Q8N8Q1 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
CYB561D1Q8N8Q1 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CYB561D1Q8N8Q1 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CYB561D1Q8N8Q1 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CYB561D1Q8N8Q1 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CYB561D1Q8N8Q1 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CYB561D1Q8N8Q1 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CYB561D1Q8N8Q1 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CYB561D1Q8N8Q1 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms