Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Y2

CRACR2B, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2BQ8N4Y2 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRACR2BQ8N4Y2 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRACR2BQ8N4Y2 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRACR2BQ8N4Y2 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRACR2BQ8N4Y2 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRACR2BQ8N4Y2 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRACR2BQ8N4Y2 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRACR2BQ8N4Y2 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRACR2BQ8N4Y2 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRACR2BQ8N4Y2 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRACR2BQ8N4Y2 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRACR2BQ8N4Y2 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRACR2BQ8N4Y2 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRACR2BQ8N4Y2 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRACR2BQ8N4Y2 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRACR2BQ8N4Y2 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRACR2BQ8N4Y2 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRACR2BQ8N4Y2 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRACR2BQ8N4Y2 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRACR2BQ8N4Y2 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRACR2BQ8N4Y2 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRACR2BQ8N4Y2 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRACR2BQ8N4Y2 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRACR2BQ8N4Y2 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRACR2BQ8N4Y2 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CRACR2BQ8N4Y2 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CRACR2BQ8N4Y2 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CRACR2BQ8N4Y2 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CRACR2BQ8N4Y2 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CRACR2BQ8N4Y2 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CRACR2BQ8N4Y2 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CRACR2BQ8N4Y2 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CRACR2BQ8N4Y2 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CRACR2BQ8N4Y2 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CRACR2BQ8N4Y2 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CRACR2BQ8N4Y2 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CRACR2BQ8N4Y2 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CRACR2BQ8N4Y2 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CRACR2BQ8N4Y2 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CRACR2BQ8N4Y2 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CRACR2BQ8N4Y2 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CRACR2BQ8N4Y2 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CRACR2BQ8N4Y2 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CRACR2BQ8N4Y2 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CRACR2BQ8N4Y2 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CRACR2BQ8N4Y2 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CRACR2BQ8N4Y2 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CRACR2BQ8N4Y2 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CRACR2BQ8N4Y2 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CRACR2BQ8N4Y2 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CRACR2BQ8N4Y2 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CRACR2BQ8N4Y2 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CRACR2BQ8N4Y2 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRACR2BQ8N4Y2 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRACR2BQ8N4Y2 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRACR2BQ8N4Y2 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRACR2BQ8N4Y2 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRACR2BQ8N4Y2 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRACR2BQ8N4Y2 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRACR2BQ8N4Y2 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRACR2BQ8N4Y2 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRACR2BQ8N4Y2 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRACR2BQ8N4Y2 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRACR2BQ8N4Y2 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CRACR2BQ8N4Y2 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRACR2BQ8N4Y2 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRACR2BQ8N4Y2 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CRACR2BQ8N4Y2 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRACR2BQ8N4Y2 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CRACR2BQ8N4Y2 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CRACR2BQ8N4Y2 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRACR2BQ8N4Y2 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRACR2BQ8N4Y2 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRACR2BQ8N4Y2 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRACR2BQ8N4Y2 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRACR2BQ8N4Y2 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRACR2BQ8N4Y2 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRACR2BQ8N4Y2 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRACR2BQ8N4Y2 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRACR2BQ8N4Y2 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRACR2BQ8N4Y2 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRACR2BQ8N4Y2 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRACR2BQ8N4Y2 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRACR2BQ8N4Y2 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRACR2BQ8N4Y2 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRACR2BQ8N4Y2 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRACR2BQ8N4Y2 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRACR2BQ8N4Y2 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRACR2BQ8N4Y2 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRACR2BQ8N4Y2 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRACR2BQ8N4Y2 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRACR2BQ8N4Y2 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRACR2BQ8N4Y2 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRACR2BQ8N4Y2 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRACR2BQ8N4Y2 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRACR2BQ8N4Y2 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRACR2BQ8N4Y2 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRACR2BQ8N4Y2 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRACR2BQ8N4Y2 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRACR2BQ8N4Y2 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms